clusterProfiler包是Y叔开发的一个强大的能进行多种功能富集的R包，对于有OrgDb或AnnotationHub中收录的物种进行GO和KEGG的富集分析非常的方便...
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使用clusterProfiler包对非模式生物进行GO和KEGG的富集分析
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cufflinks使用-2 (2018-05-29)
更多请了解Cufflinks: http://cole-trapnell-lab.github.io/cufflinks/ Cufflinks 利用Tophat比对的结果（a...
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RNA-seq：转录组数据分析处理（上）（2019/05/07更新）
superqun原创 一、流程概括 RNA-seq的原始数据（raw data）的质量评估 linux环境和R语言环境 raw data的过滤和清除不可信数据（clean r...
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RNA-seq基因可变剪切分析
###因为gtf和fastq的对应关系，从igenome上打包下载所有hg19的信息## 1. tophat2比对 tophat2 -p 15 -G ../reference...
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RNA-seq练习 第二部分（基因组序列下载，注释文件下载，索引下载，比对，比对质控,HTseq-count计数，输出count矩阵文件）参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载，它们分别是：1.NCBI （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc）2.UCSC (http://h...
