安装配置conda 使用清华源下载sh脚本并安装 下载完成后直接运行脚本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。需要输入yes然后等...
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转录组RNA-SEQ上游分析2020 -
「r<-包」从UCSC Xena 拉取数据做生存分析
这是最近赶的一个 deadline 作品，之前答应了 rOpenSci 投一个 technote 小博文。因为不能重复包 Vignette 的内容，所以本文我使用了生存分析这...
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scRNA-seq数据分析 || Monocle3同系列文章： sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jianshu.com/p...
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单细胞数据分析||Introduction to single-cell RNA- seq data analysis为什么要做单细胞？ 可以得到单个细胞的表达谱 可以发现新的细胞类型或者细胞状态（这里面往往蕴含着未知的生物学状态或者过程） 识别细胞发育轨迹或者病变细胞发生发展进程。 数据分...
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R for data science ||使用dplyr进行数据转换数据转换 data transfer,是将数据从一种表示形式变为另一种表现形式的过程。我们喂给程序的数据在任何一个阶段都要符合这个程序的数据要求，可视化也好，聚类也好，每一种...
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单细胞转录组||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jianshu.com/p...
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TCGA数据库下载：多种方法及优缺点介绍在TCGA数据库下载文件有很多种方法： 一.利用R语言下载（本文重点介绍这个） 方法1：TCGAbiolinks包（首推这个方法！！目前没发现明显缺点） 方法2：RTCGAT...
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【单细胞分析】seuratV3简介及实操Seurat简介 Seurat[https://satijalab.org/seurat/]---几乎是当前单细胞RNA-seq分析领域的不可或缺的工具，特别是基于10X...
