看文献的时候，发现了g:Profiler这个宝藏工具，测试了一下，使用起来超级方便、好用，一定要分享给大家~ g:Profiler网址： https://biit.cs.ut...
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批处理！功能富集分析、基因ID转换、查找同源基因、SNP注释一站式服务
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seqtk: fastq reads 随机抽提
seqtk 用于随机reads 抽提 安装：conda install seqtk如果没有安装conda , 先安装conda ,或者直接下载seqtk 安装包，进行安装 s...
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SRA Toolkit的使用和安装从NCBI上下载SRA原始数据，使用SRA TOOLKIT 进行下载和转化。 1. 下载SRA Toolkit （注意找准自己的版本）https://trace.ncbi.n...
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「生信」共线性分析——MCScanX目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便使用者发现共线性(collin...
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「基因组注释」使用RepeatModeler从头注释基因组的重复序列
RepeatModeler可用来从头对基因组的重复序列家族进行建模注释，它的核心组件是RECON和RepatScout。 使用方法 以拟南芥的参考基因组为例，假设基因组的名字...
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使用ggplot2个性化绘制GO富集分析柱状图好久没更新了 今天就更新一波，今天的主题是如何使用ggplot2个性化绘制GO富集分析柱状图。进入正题,为什么选择利用ggplot做图，而没用clusterProfiler自...
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如何用WGDI进行共线性分析(上)多倍化以及后续的基因丢失和二倍化现象存在于大部分的物种中, 是物种进化的重要动力。如果一个物种在演化过程中发生过多倍化，那么在基因组上就会存在一些共线性区域（即两个区域之间的...
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使用Maxent最大熵模型模拟物种适生区操作步骤1.所需软件： Maxent生态位模型软件 (此软件是用Java语言编写的，需Java运行环境，请先去Java官网(http://java.com[https://link....
