1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析，它可用于研究1个因素对于生存时间的影响。参考：生存分析之Kaplan-Meier曲线都告...
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Kaplan-Meier生存分析的结果解读和绘制方法 -
实战之 mutect2检测somatic变异流程1 用途 mutect2是GATK（The Genome Analysis Toolkit，是BroadInstitute开发的用于二代重测序数据分析的一款软件，里面包含了很...
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多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony练习数据集的GEO编号：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
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生信 | 三维基因组技术（二）：Hi-C辅助组装与Lachesis的使用写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Hi-C 辅助组装（PGA...
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3D基因组—实验技术
一、3D基因组之ChIP-seq 基因组的三维立体结构的主要组成是DNA和蛋白质。研究基因组的三维立体结构就是研究DNA与蛋白之间的互作。ChIP一直是研究蛋白与DNA互作的...
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走向基因组3D世界 ——染色体构想捕获技术3C(chromosome conformation capture)
在过去10年中，染色体构象捕获（chromosome conformation capture 3C）技术及其该技术的拓展技术(4C,5C,Hi-C,ChIA-PET)，使人...
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R-Markdown学习与使用简介 markdown是一种纯文本格式的标记语言，只需要简单的标记语言就可将文本格式的内容具有一定的格式。核心是将文字与排版分开，从而将注意力集中于文字本身。但其本质，M...
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R markdown 学习笔记## Markdown语法 -标题 一个#是一级标题，二个#是二级标题，以此类推。支持六级标题。 # 这是一级标题 ## 这是二级标题 ### 这是三级标题 ...
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植物RNA-seq (Salmon)从软件安装到下游分析(纯Mac) 4.8更完写在前面： 整个流程是首次从软件安装-数据下载-上游分析-下游分析。代码没毛病，奇怪的是salmon比对后，mapping～15%（不正常），一般来说期望mapping应该是...
