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一一对应的geneid，unique1对应的
甲基化数据预处理（R语言）
一. 实验目的 学习如何下载甲基化数据及如何获得每个探针的甲基化水平（beta值）。 二. 实验数据及步骤 数据：来自GEO GSE27284_non-norm...
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你看看mu_exp的数据类型，一般要矩阵
共突变通路识别（R语言实现）
写在前面：我认为此次的任务重点在理清楚实验原理和步骤，代码部分比较基础也可用来研究共突变基因 一．实验内容 共突变通路识别具体原理步骤如下 二．实验目的 （1）掌握通路富集方...
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筛选差异基因，倍数法，t检验，SAM一、 实验内容利用SAM筛选差异基因比较筛选差异基因的方法：倍数法，t检验，SAM二、 实验目的 掌握筛选差异基因的方法，为了探究倍数法，t检验，SAM这三种筛选差异基因...
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利用MATLAB实现FDR校正
芯片差异分析就是 对每个基因做t-test为什么要进行FDR校正多重检验问题:同时识别两个总体的成千上万个基因中哪些基因的表达水平有显著性差异，错误的概率在增加设定假设检验水...
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多重比较-Bonferroni法和Benjamini & Hochberg法本次笔记主要介绍多重比较下两种常用的矫正P值的方法：Bonferroni法和Benjamini & Hochberg法（BH法） 多重比较问题 假设检验的基本原理是小概率原理...
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2022《Cell》 作物驯化与育种中的整合基因组学导读 野生植物被成功地驯化为农作物是人类文明的大事件。该过程的成功很大程度上要归功于持续的人工选择。本文总结了过去十年在作物驯化和育种研究中的新发现。作物基因组图谱的构建和众...
