转录组分析一般通过比对或非比对的方法对基因表达进行定量，得到一个样本-基因表达矩阵用于下游数据分析。下游分析通常是进行差异表达分析，对差异基因进行功能注视，如Gene Ont...
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Bulk RNA-seq上游分析流程（Salmon）
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2023-01-06引物设计
特异性 https://baijiahao.baidu.com/s?id=1725532284055028787&wfr=spider&for=pc 设计原则 https:/...
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2022-11-09
# 提取KEGG基因集方法一 if(!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.package...
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R-下载某一条通路的所有基因名字（KEGG）实例：如何拿到KEGG数据库中多巴胺通路相关的基因集 一、确定目标通路 打开KEGG选择pathway，在搜索框前输入物种，框内填入关键词。 筛选结果显示仅有hsa04728...
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R语言获取 GO/KEGG 中某一通路的基因集
有时候我们想看某一特定通路的富集情况，这时就需要获取该通路的基因集。 一、从 GO 中获取 下载脚本 getGoTerm.R[https://github.com/Jiaha...
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Seurat单细胞分析常见代码-01
1.如何通过Seurat对象获取细胞对应的坐标? 2.如何通过Seurat对象获取原始表达数据? 3.提取特定基因阳性表达的细胞？ 4.修改tsne/umap图的配色 5.查...
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Cre-LoxP条件性基因编辑系统--学习笔记背景 Cre/LoxP系统来源于F1噬菌体，是非常经典有效的基因编辑技术。 1. 什么是Cre Cre重组酶(cyclizationrecombination)，它是一种由3...
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Cre小鼠的简介与应用1. Cre-loxp系统及其应用介绍 Cre-loxp系统源于P1噬菌体的高效重组系统。Cre (Causes recombination; Cyclization rec...
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流式细胞仪分析技术及应用在2019年的三月份我正式开始做单细胞相关研究工作，有趣的同时也是朋友我们经常误会的是：你是不是用流式细胞术？而我在得知自己要做这单细胞（single cell ）的研究时，...
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2021-04-10
代码1：expr <- as.matrix(kidneyMPC@assays$RNA@data) 报错1：Error: cannot allocate vector of s...
