刘小泽写于18.11.21聚类树是个有意思的东西，可以十分直观地看到每个物种的亲缘关系之前没有涉及到相关的分析，相关的工具只是听说过大家都在用的MEGA，另外还有Y叔的ggt...
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转录组分析----数据下载From 生信技能树 的娟老师 1、从数据库中下载之后通过xftp传递到服务器上。（传递到当前目录，利用pwd命令看当前路径，之后复制到ftp） 2、我们利用asp软件下载...
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使用rsync下载PDB数据库
2018.5.28 星期一 多云 biolearn 从PDB数据库下载复合物的结构有两种方式，一是直接通过网页检索下载，二是使用rsync从PDB ftp端下载。 下载指...
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利用NetworkAnalyst在线工具对GEO数据库中表达基因进行差异分析上一个课程，我们对NetworkAnalyst在线工具进行概述，简单回顾一下，我们使用的NetworkAnalyst包括五个功能模块，分别是 1）Gene list inpu...
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简单小需求：如何将FPKM转换成TPM？
刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析，得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性，推荐使用TPM。 read count和FPKM...
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Motif和domain的区别Protein domain： 结构域domain的概念由Wetlaufer于1973年首次提出，他定义结构域为可以自动折叠的稳定的蛋白质结构单位。过去，结构域被描述为，折叠...
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蛋白和转录组联合分析数据库推荐现在多组学研究很火，今天小编给大家介绍几个蛋白组学和转录组学联合分析实用数据库： 1 CRN（Cancer RNA-Seq Nexus）数据库 网址：http://sysl...
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R语言转录组分析-GEO数据库下载及Illumina数据处理一、简单认识一下GEO数据库 入口：在NCBI主页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 的搜索入口输入关键字，比如某个基因或某个疾病，选择数据类型为GE...
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转录组分析——利用GEO数据挖掘构建基因表达图谱一、前言 前段时间主管让我在GEO数据库弄个表达图谱，准备接下来做各种转录组分析，现在回过头来，觉得这个东西比较简单，十分适合上手练习。思考了一下，决定写下来分享给大家。注意...
