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R语言|两因素重复测量方差分析 -
单细胞转录组揭示视网膜细胞异质性A single-cell transcriptome atlas of the adult human retina 遗传性视网膜疾病正成为成人失明的主要原因，当前已鉴定到...
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Step-by-Step:使用R语言进行断点回归(RDD)分析1. 简介 断点回归（Regression Discontinuity）适用于以下情形：人群是否接受干预（Treatment）是依据某一数值变量（rating variabl...
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RNA-seq下游分析（3）-rawcount转换为TPM及RPKM格式
因为我用的GTF文件较新，为realease101版本，因此需要自己生成转换文件需要的TxDb文件，首先需要安装GenomicFeatures包，然后直接在线应用命令进行数据...
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转录组时间序列数据处理针对转录组数据，平时分析中最常见两组之间的比较，比如不同处理或者不同突变体。面对这样的数据用用 DESeq2 或者 edgeR 基本就差不多。如果样本量或者不同条件很多的话可...
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套路老掉牙，但是也得学学：lncRNA–miRNA–mRNA调控网络预测
今天给大家分享一篇与lncRNA–miRNA–mRNA调控网络预测相关、发表在Journal of Cancer Research and Clinical Oncology...
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【R>>Mfuzz】时间序列分析时间序列分析：对不同时间点（状态）转录组或蛋白表达谱数据，进行模糊c均值聚类（fuzzy c-means clustering, FCM），找出具有相似表达模式的基因或蛋白并...
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2021-04-10 RNA-seq批次效应
批次效应指样品在不同的批次处理和测量时引入的与生物状态不相关的系统性的技术偏差。很多因素都可能导致批次效应的产生，如不同实验条件、不同操作者、不同公司的试剂、不同批的试剂、实...
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airway数据集探索airway数据集的下载 airway数据集简介 airway数据集是人平滑肌细胞的RNA-seq测序的原始counts数据。 airway数据集探索 colData 这一列...
