发简信
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基于AlphaFold2进行蛋白质结构预测的文章解析01 蛋白质结构基础 基础介绍[1][#fn1] 蛋白质是一切生命系统的物质基础，密切每一个生理过程。 每个蛋白质因基酸链的组成、扭转、弯曲等等构成不同具有特异的结构，决定...
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基因家族的系统进化树-基于Windows系统上的iqtree之前的序列提取教程请看：https://www.jianshu.com/p/211a262aebc4。 之前的基因家族鉴定教程请看：https://www.jianshu.c...
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重测序分析（15）GWAS分析实操（1）gwas_emmax介绍如何使用SNP数据进行GWAS分析，软件选择为emmax和tassel。 软件选择 emmaxplinkqqmanCMplot 数据准备 vcf文件：all_snp.vc...
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如何下载基因组注释文件和复制链接（以GCA_000817325.1为例）进入NCBI，search 这样就可以直接下载基因组注释文件啦 如何得到基因组注释文件的链接？ 下载 wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ge...
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序列比对之blast在线和本地使用序列比对（Sequence Alignment） 比较两个或两个以上序列的相似性 blast（Basic Local Alignment Search Tool） 是一种序列...
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TBtools | 「金词金句」插件，再也不担心 Paper 写不好了~写在前面 前几天，我推出了「TBtools」的「Simple Dict」功能，可以实现实时划词翻译，而且是全局的。无论本地看 word 文档，pdf 文档 更或者 浏览器，聊...
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快速 | 蛋白序列两两相似度矩阵计算写在前面 Emmm，有时候，我们可能通过一些比对软件，如 BLAST , DIAMON 或者 ghostz 得到一堆序列比对结果。当然，我们也可能从一些公共数据库如 NR, ...
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RDP使用手册
标签：生信分析，系统发育 背景：RDP是一款检测重组或重配的软件，适用于Windows 95/98/NT/XP/VISTA系统的软件（其实win7/8/10也可以），这款...
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生物信息学研究。
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4️⃣ 核酸序列特征分析(0):DNA序列基本信息分析(组分分析和序列转换)序列比对和序列特征分析总目录 1 DNA序列组分分析 DNA的物理化学性质主要由碱基组成决定，有两种方法表示：碱基比例base ratio和GC百分含量简称GC含量GC co...
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分子进化树构建及数据分析方法介绍【转】
首先是方法的选择。基于距离的方法有UPGMA、ME（Minimum Evolution，最小进化法）和NJ（Neighbor-Joining，邻接法）等。其他的几种方法包括M...
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开源社是由中国支持开源的企业、社区及个人所组织的一个开源联盟，旨在推广开源。
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微信号：AK41_7
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系统发育分析之贝叶斯BI构建系统发育树主要有四种方法：ML、NJ、MP和BI。 与ML和NJ相比，BI的方法效率更高，已有的研究结果显示,对于同一组数据的分析,贝叶斯方法分析结果中的节点支持率高于其...
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本地化的NCBI BLAST+的安装及使用
在生物信息学，BLAST(基本的局部比对搜索工具)是一种算法，用于比较生物的序列信息，诸如蛋白质的氨基酸序列、DNA或RNA核苷酸序列。BLAST搜索使研究人员能够将一个目标...
