肠道菌群，血清/血浆代谢组 貌似几乎可以跟一切疾病一切机体状态进行关联，包括本研究的妊娠期糖尿病。孕期糖尿病显然会更复杂，可能改变正常孕期，影响胎儿。 那么妊娠期糖尿病的生理...
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相关性分析发挥极致 - 血清代谢组与肠道宏基因组 -
肌肉和内脏脂肪代谢组学与转录组学们看看脂肪代谢组学和mRNA转录组学分析，文章的谋篇布局。 文献题目：脂质组学和转录组学鉴定德州驴肌内脂肪和内脏脂肪组织的异质性 背景：瘦肉里有脂肪，内脏有脂肪，为什么瘦肉里...
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代谢组方法探讨塑料颗粒对肝肺细胞的影响塑料是常见污染物，都说对人类是有危害的，影响到底有多大呢？使用肝细胞，肺细胞作为模型，从代谢组学的角度探讨可能的表型改变。 文献题目：代谢组学揭示纳米颗粒诱导的人肝和肺细胞线...
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肺纤维化组织的转录组 + 蛋白组学背景：前人分开测过很多次肺纤维化组织的转录组，蛋白组，也一起测过，我们还是得测一次，毕竟别人有数据，数据也不是我的。我这边测一测，手里有差异分子表，也好开展后续的机制研究。 ...
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蛋白组+基因组+单细胞测序分析肿瘤分型做了多个组学的数据，该怎么分析呢？ 本文章题目：单细胞RNA测序辅助多组学分析发现肝内胆管癌分子亚群 数据：（1）110个（分析）+ 41个（验证集）患者的ICC组织蛋白组学...
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基因敲除模型的转录组与蛋白组分析上一篇我们看了临床组织标本转录组与蛋白组一起分析，如果研究某个基因，对其进行敲除后同时做转录组蛋白组一般会做哪些分析，得到哪些结果，如何展示图及讨论呢？ 本文题目：南美白对虾...
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转录组和蛋白组学比较淋巴结与肿瘤沉积区别背景说明： 肿瘤不只原发灶与癌旁，还有很多其他位置的病理组织，比如淋巴结转移，以及周围肿瘤细胞的聚集体（非原发灶）。肿瘤细胞聚集体的重要性比不上原发灶，但也应该要考虑研究的。...
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@墨墨_eea8 前边是对照，后边是处理。
edgeR差异基因分析的一般过程
基于转录组测序获得的定量表达值，识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子，实际上方法还是非常多的。但就目前来看，DESeq2和edgeR是出现频率最高的两种方法了。 DE...
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描述性文章写作思路-m6A测序本期我们一起了解一下，m6A测序描述性文章的写作思路 以下是视频录屏链接，有需要的老师可以观看。 B站超清链接： 上：https://www.bilibili.com/vid...
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生信文章这么“虚”，其意义何在？
我们在网上看到某些公众号在铺天盖地的推“生信文章”，号称点点鼠标，5分钟出来一篇三分SCI的数据。有的机构，甚至给出了每个图的脚本，一步步出图，换一种肿瘤就是一篇文章。嚣张程...
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m6A机制研究5：lncRNA、circRNA与m6A关联的4种思路上期我们回顾了几种m6A基本机制，有讲解了m6A机制的核心机理，今天我们在此基础上讨论一下，lncRNA/circRNA与m6A机制关联的几种思路。 以下是视频录屏链接，有需...
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RNA分子m6A机制研究4：核心机理
m6A 是目前研究的热点，最近出来的高分文章很多。相当多的老师是在研究m6A对靶标RNA的调控机制。我们在2020年底讨论过3类m6A的经典思路。 1. 从甲基酶/去甲基酶入...
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lncRNA高分机制思路-4：研究中一些重要是实验 （上）
lncRNA机制研究从样本的准备提取、到结论的猜想验证等等，通常会做各种各样的实验，本期我们就跟大家一起来解一下在lncRNA机制研究中部分常见的实验。 以下是视频录屏链接 ...
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lncRNA高分机制思路-3：“操控”结合蛋白的十种策略
lncRNA机制研究最常见的机制是通过结合某蛋白，调控该蛋白的功能。当我们打算做这方面的研究时，需要考虑结合蛋白，通常会有什么样的改变呢？表达量变化？功能的改变？怎么分析？我...
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lncRNA高分机制思路-2：SNP调控lncRNA机制讨论在lncRNA机制研究里，有一小众人群在做SNP调控lncRNA表达，或功能改变的机制研究，不少CNS文章。SNP是突变位点，已报道许多重要的SNP与疾病密切关联。那么这些S...
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lncRNA高分机制思路-2：SNP调控lncRNA机制讨论
在lncRNA机制研究里，有一小众人群在做SNP调控lncRNA表达，或功能改变的机制研究，不少CNS文章。SNP是突变位点，已报道许多重要的SNP与疾病密切关联。那么这些S...
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lncRNA高分机制思路-1：调控临近基因表达lncRNA是个神奇的分子，被研究了很多年，可依然还有大量的高分文章发表。小编收集了2020.06以来的lncRNA文献，发现超过10分的机制文章不下百篇。可以看出，做lnc...
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2021.01.11 ARTIF CELL NANOMED B 撤回中国10篇医学文章，原因令人费解...
Artificial Cells Nanomedicine and Biotechnology是一门跨学科期刊，在人工细胞、纳米医学和健康相关生物技术的融合中发表了高质量的开...
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circRNA测序-病毒circRNA与宿主细胞互作思考circRNA的研究很火热，不过思路大体就那么三四种，ceRNA机制，结合蛋白，翻译多肽，m6A甲基化调控。很多老师希望做出新意。 我们平时看文献可能看到过，研究肿瘤中的病毒...