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  • 近日二三事 --- 读博与现实

    写在前面 很多事情,只有自己经历了,才有所体会。或许有很多硕士,与我当时一样,以为读博士与读硕士是类似的状态。鼓捣鼓捣实验,搞搞数据分析,稀里糊涂,基本能满足要求就可以毕业走...

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    GATK4.0和全基因组数据分析实践(上)

    前言 在前面的一系列WGS文章中,我讲述了很多基因数据分析的来龙去脉,虽然许多同学觉得很有帮助,但是却缺了一个重要的环节——没有提供实际可用的数据来实战完成具体的流程,不能得...

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    【基因课】测序数据过滤和质控

    1. 课程大纲 基础知识 数据质控 Fastqc结果解读 数据过滤 2. 学习笔记 2.1 基础知识 2.1.1 测序原理 Sample Prep:DNA随机打断加adapt...

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    第2篇:原始数据的质控、比对和过滤

    这部分内容包括对原始测序数据质控,然后比对过滤,这是所有NGS数据处理的上游分析。 ATAC-Seq与其他方法不同的一点是需要过滤去除线粒体(如果是植物,还需要过滤叶绿体),...

  • NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明

    tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要,去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...