之前使用gblocks裁剪比对序列，感觉裁剪的不是很智能，大量可能有用的序列被裁剪掉，所以尝试使用trimal。 1.下载安装 在自己目录下输入 导入trimal安装包（如果...
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轮状病毒进化分析-Rotavirus步骤一：数据清洗 将ID重复的进行筛除，经过初步计算进化速率为0.9E-3，将同年序列差异<=3的进行随机筛选，保留一个。最后得到147条VP7序列。我为啥做这一步，我在N多...
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关于NCBI-SRA数据不再提供质量值的解决方案近期在NCBI SRA中下载的FastQ数据不再提供质量值信息（图1和图2），据说是为了后期便于敛财收费提供质量值，鄙人对这种万恶的资本主义行径大为不齿，NCBI这是自绝于世...
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应用Aspera高速下载NCBI和EBI数据
1 安装 Aspera 2 下载数据 2.1 NCBI数据下载 下载链接：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/viral/...
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容器启动异常 devicemapper: Error running deviceCreate (CreateSnapDeviceRaw) dm_task_run failed
异常:Cannot create container for service xmq: devicemapper: Error running deviceCreate (C...
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基因结构注释（2）：同源注释同源预测(homology prediction)利用近缘物种已知基因进行序列比对，找到同源序列。然后在同源序列的基础上，根据基因信号如剪切信号、基因起始和终止密码子对基因结...
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R包安装报错：nzchar(SHLIB_LIBADD)
Error in if (nzchar(SHLIB_LIBADD)) SHLIB_LIBADD else character() : argument is of lengt...
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GenomeScope 2.0 评估基因组大小、杂合度和重复序列GenomeScope 是2017年发表在 bioinformatic 的一个工具，这个工具的目的就是处理一些高复杂度的基因组，比如说高杂合度或者基因组非常大的物种。Geno...
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