前言 使用 pheatmap 已经能够绘制满足大多数要求的聚类热图了。 受 pheatmap 包的启发，ComplexHeatmap 提供了对热图更多更灵活的控制，如多数据热...
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R 数据可视化 —— 聚类热图 ComplexHeatmap(一) -
sc-Review：单细胞RNA-seq数据分析最佳实践Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutoria...
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转录组分析5——差异表达分析差异表达分析内容：• 基因表达量的标准化方法及可视化➢ counts，RPKM，FPKM，TPM➢ PCA图、热图等• 差异表达分析及可视化➢ limma-voom，edge...
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详解如何获取物种所有基因对应的GO注释
欢迎关注”生信修炼手册”! Gene Ontology是研究基因功能的重要数据库之一，在进行GO的富集分析时，需要提供所有基因对应的GO注释信息，本文介绍几种获取该信息的方式...
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RNA-seq入门实战（四）：差异分析前的准备——数据检查本节概览：数据预处理, 进行样本间具有可比性boxplot查看样本的基因整体表达情况查看不同分组的聚类情况：样本hclust 图、距离热图、PCA图、差异基因热图、相关性热图...
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DESeq2差异分析十全大补使用笔记写在前面：新手老菜鸟，个人心得，不足之处欢迎交流指正；写作不易，转载前请联系我征得同意，谢谢。 1.基本原理 1.1 概述 全称：DESeq2 package for dif...
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数据分析：基于DESeq2结果的基因富集分析介绍 DESeq2常用于识别差异基因，它主要使用了标准化因子标准化数据，再根据广义线性模型判别组间差异（组间残差是否显著判断）。在获取差异基因结果后，我们可以进行下一步的富集...
