DESeq2文库标准化 问题1：调整文库大小的差异 样本1的read是样本2的一半,样本2中每个基因的read是样本1的两倍。这种差异不是生物学造成的，而是测序深度造成的。R...
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12高通量测序-DESeq2文库标准化 -
如何要展示logFC的大小在通路图里，这个cpd.data是不是可以理解为KO代谢物对应的gene的FC值
KEGG分析工具：pathview基本操作
什么是KEGG KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分析基因功能、基因组信息数据库，它有助于研究者把基因及表达信息...
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data(geneList,package="DOSE")是什么意思？geneList是哪里来的
构建自己的R包--KEGG.db
参考地址在使用clusterProfiler时，KEGG注释包，可以自定义。毕竟许多物种的数据库是不完善的。现在就自定义一个KEGG.db的包，用于KEGG注释。 简单快捷方...
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前言科学-3D2Y<br><br>简书博客<br><a href="http://www.jianshu.com/u/599a9e91afc8" rel="nofollow" target="_blank">http://www.jianshu.com/u/599a9e91afc8</a><br><br>CSDN博客<br><a href="https://blog.csdn.net/leadingsci" rel="nofollow" target="_blank">https://blog.csdn.net/leadingsci</a><br><br>微店：<br><a href="https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile" rel="nofollow" target="_blank">https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile</a>
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孙振球, 徐勇勇. 医学统计学.第4版[M]. 人民卫生出版社, 2014. 从R语言和统计学小白的过渡。。。 更加优质的阅读体验：https://x2yline.github.io/statistics_note/ 简书不支持latex语法。。。
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《极简统计学》-帮你快速入门统计学作为前数学专业毕业生，学过的概率统计知识已经忘记得差不多了，对于统计学的概念能清楚记得的也只有方差，标准差和均值了。正态分布只记得了一个曲线图了，其他性质什么的都不记得了。更...
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视频在https://www.bilibili.com/video/av49363776 ，如果大家R语言能力不够，就主要学习网页工具 https://www.cbioportal.org/ 等等，如果R语言还行，就看代码: https://github.com/jmzeng1314/tcga_example 如果确实有需要，还可以看看我们的付费内容：地址是 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/index.html
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单细胞实战2: Seurat+SingleR--从矩阵到细胞类型注释单细胞数据标准分析Seurat流程： Seurat官网：https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...
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学习资料
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HISAT2 Bowtie2 提取唯一比对 unique mapping reads
把read比对到基因组之后，需要提取唯一比对来进行下一步分析。 bowtie2和HISAT2 都没有只输出唯一比对的命令，所以需要对比对结果sam文件进行提取，可以通过sam...
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浅浅的学习历程<br>生信新手，打工人，搬运工。<br>像王子文一样财务自由，才可实现生育自由<br>像李子柒一样把一件事情做到极致，才可实现职业自由
