本文参考：分子生物学实验常用抗生素的配制[https://www.jianshu.com/p/e510b7cfb164],在其基础上补充了部分内容。 1. 氨苄青霉素（Amp...
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实验室抗生素母液配制
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RIdeogram：染色体数据可视化的R包已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在线工具Idiographica，虽然能绘制直的...
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Mash: 使用MinHash快速估算基因距离
工具介绍 Mash扩展了MinHash降维技术，使其成对的突变距离和P值显着性检验，从而可以有效地聚类和搜索大量序列集合。混搭将大序列和序列集还原为较小的代表性草图，进而可以...
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基因家族分析（3）进化树构建及美化基因家族树构建最常用的方法是 NJ 法和 ML 方法，构建进化树之前，需要进行多序列比对。 多序列比对 多序列比对的作用是将核酸或者氨基酸序列对齐，使得相同残基的位点位于同一...
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基因家族分析（5）绘制基因结构图本节介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server（GSDS），简单好用功能强大。将基因家族成员 gff3 文件单独提取出来，运用它...
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全基因组复制 WGD |（一）简介
01 什么是全基因组复制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/复制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因组内的所有序列都发生重复，...
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pacbio 的bam文件转成fasta文件
使用软件SMRTlink 9转换。 PacBio官网下载SMRTlink 9， https://downloads.pacbcloud.com/public/software...
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「BioNano系列」如何"从头组装"出一个Bionano图谱官方并没有一个很详细的文档描述Bionano的从头组装流程的具体过程，所以我只能根据自己实际项目进行介绍: AutoNoise + SplitBNX: 这一步会将bnx和参考...
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R语言处理PCR数据，一步画柱状图、添加显著性标志并实现截断PCR数据要有三列，一列是组名，一列是内参基因的CT值，一列是目的基因的CT值，计算方法是-2∆∆Ct 法，实现一步出图用的是ggpubr，实现截断则是Y叔出手的ggbrea...
