黄树嘉

什么是Phasing？ Phasing，或者说Genotype Phasing，它的中文名有很多：基因定相、基因分型、单倍体分型、单倍体构建等在不同的语境下都有人说过。但不管...

王诗翔

使用lattice进行高级绘图是我之前在学习《R实战》这本书少有涉及的章节之一，在R里面，主要有两大底层图形系统，一是base，二是grid。lattice与ggplot2正...

生信杂谈

WGCNA分析基于两个假设：1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路，2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点，可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...

黄树嘉

这是我根据之前的WGS系列和GATK4实践文章进行重新梳理之后确定下来的分析流程，这是一个WGS的最佳实践，它基于GATK4和我的实际经验，稍作修改即可应用到实际的项目中。我...

生信杂谈

不管从哪个角度看我们都希望测序仪产出的数据中duplicate 率尽量低。怎样降低 duplicate 率？ 构建文库时，核酸提取质量要好，起始 DNA 量要足够多，建库过程...