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TOP生物信息

这是一个新系列 差不多是一年以前，我定导后没多久，接手了读研后的第一个课题。合作方是医院，和我对接的是一名博一的医学生，最开始两边的老师很排斥常规的单细胞文章思路，即各大类细...

BINBINCC

在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...

生信宝库

前言 在生发中心（Germinal Center，GC）形成的过程中，滤泡辅助性T（T follicular helper，Tfh)细胞承担着重要的角色。最初，科学家们基于其...

Geekero

T 细胞（全部）：CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef（效应T细胞）： 辅助...

凌川美兮

2020-05-26 图1给了我们分析的完整过程，图2,3,4是分析的具体过程。 我们输入到GSVA文件中的表达数据，行为基因名，列为样本名。 第一步是根据输入的表达数据按照...

黄甫一

适用背景 单细胞转录组调控网络分析是单细胞转录组分析内容的高级分析之一，本文将介绍SCENIC/pySCENIC的流程，具体原理和内容不展开，主要展示代码复现流程。R的SCE...

Hayley笔记

AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集（如gene signature,gene module）的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...