同样是一篇医学的GWAS文章， 其对将多个研究的SNP排序列表整合为一个列表。原因：由于基因组研究的巨大异质性和有限的后续研究资源，只给出部分和/或排名最高的列表很普遍。为了...
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GWAS - 3 多种算法结果的结合处理 -
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R语言中的连接dplyr中的join系列与merge函数
在数据分析过程中，仅仅涉及一张表格的情况是非常少见的，我们经常需要联系到其它表格的数据，整合这些表格的信息。这时我们需要常见的三类操作来完成。 合并连接：根据观测合并表格 筛...
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最大似然估计（ML）和REML
A.F. Zuur et al., Mixed Effects Models and Extensions in Ecology with R, p116-119, chr ...
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GWAS与GS模型介绍与比较最近看了不少统计基因组方面的资料，以为懂了，其实懵逼。实在是因为统计学基础太菜，似懂非懂，似是而非。记录下自己的理解，求轻喷。 1.GWAS模型 GWAS是表型和基因型之间的...
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6 - 多性状动物模型（Multivariate Models）根据前面讲的（第5），这里增加多性状模型。 1 多性状动物模型主要用于以下情况： 问题：计算复杂解决：需要好的计算算法和 计算机eg:Canonical transforma...
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Weigel2017 奶牛育种百年回顾：方法和基因组选择——从母女比较到深度学习Weigel, K.A., VanRaden, P.M., Norman, H.D., and Grosu, H. 2017. A 100-Year Review: Meth...
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基因组选择常见问题FAQ
基因组选择常见问题FAQ 文献: FAQ for genomic selection 这是一篇文献, 介绍GS常见的问题, 翻译并学习. 1, 我听说如果有1000个动物的基...
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学习 | BLUP与全基因组选择
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