1. ATAC-seq和ChIPseq原理介绍 ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high t...
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ATACseq和ChIPseq
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单细胞分析之细胞交互-1：CellphoneDB常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...
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R 数据可视化 —— 聚类热图 ComplexHeatmap(三)热图列表前言 我们继续介绍 ComplexHeatmap，今天要介绍的内容是热图列表。 ComplexHeatmap 包的一个重要的功能是，能够在水平或竖直方向连接多个热图和注释，以...
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数据上传 | GEO数据上传操作指南科研工作者在发表paper的时候，如果文章中涉及高通量测序数据分析，就需要提前向NCBI上传数据获得登录号。然而，如何向NCBI提交这些序列？提交什么序列？总是提交失败怎么办...
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生信分析学习笔记 - RNAseq （二） 双端测序与单端测序声明：本文部分内容和部分图片来源于网络。本文为生信小白学习笔记，不能保证专业名词和内容全部正确或权威。 下图为某一条RNAseq从数据预处理，序列回帖到数据可视化...
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利用AUC值表征基因集在细胞中的活跃程度前言 今日份看文献《SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering》[https://www....
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Augur || 寻找最先对实验条件做出响应的细胞亚群我们提出了Augur，一种在单细胞数据中对生物扰动最敏感的细胞类型进行优先排序的方法。Augur采用了一个机器学习框架来量化高维空间中扰动细胞和未扰动细胞的可分离性。我们在单...
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热图在单细胞数据分析中的应用什么是热图？ 热图是一个以颜色变化来显示数据的可视化矩阵，Toussaint Loua在1873年就曾使用过热图来绘制对巴黎各区的社会学统计。我们就拿这张简单朴素的热图来讲一...
