前言： 这篇主要记一下如何使得本地的文件输出到网页上。（1）将通过flask_sqlalchemy把python和sql数据库联系起来，把你的文件上传到数据库上。（2）使用f...
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Flask-sqlalchemy读取文件到数据库并输出到网页上 -
解决问题‘~/anaconda3/etc/conda/deactivate.d/deactivate-gxx_linux-64.sh: Syntax error: "(" unexpected’
系统：Debian在shell中输入sudo dpkg-reconfigure dash，在弹出的页面中选择'no'。
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双端测序的mRNA-seq处理过程
1.从SRA数据库选择原始测序数据并下载【下载之前看一眼是single还是paired】 结果：在执行命令的目录下出现SRR1186241_1.fastq和SRR118624...
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TCGA-miRNA的生存分析引言：之前写了mRNA的生存分析，对于miRNA来说基本一致，只不过因为从TCGA上下载的miRNA的reads文件和mRNA有一点不一样，需要额外处理一下。TCGA-mRN...
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karyoploteR画enhancer附近的信号分布效果图： 感觉就一个不好理解的参数：r0和r1r0：是起始的高度r1：是结束的高度r1-r0才是我们想要展示内容的高度（想象这个画布本身就有刻度线） 传入的增强子文件格式：前...
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TCGA-mRNA的生存分析引言：本文主要记录mRNA生存分析过程中遇到的问题以及具体过程，生存分析用的是最常见的KM法Kaplan-Meier。 工具：TCGA的数据通过library(TCGAbio...
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不常上线，有事可以找@547的小书童呀
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用TCGAbiolinks从TCGA数据下载到下游分析的学习笔记
前言 之前一直在用RTCGA包下载数据，看着永不更新的数据，心里总觉得怪怪的，于是下定决心重新学习一个好用的包——TCGAbiolinks。这个包调用GDC的API，应该是最...
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js中++i和i++的理解
关于++i和i++的理解 最常听说的一句话就是：前置递增：先递增后赋值后置递增：先赋值后递增 再加上常用的写法是a=i++这种，有的用运算优先级解释的(很明显也不成立)，就没...
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Bowtie Error: Saw ASCII character 10 but expected 33-based Phred qual
关于这个问题的解决方法：是解答说因为有长度为0的测序数据。所以使用cutadapt 的-m参数 设置一个最短序列长度，去掉太短的测序结果。 参考：https://github...
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对JavaScript的Event对象的理解
今天写一下个人觉得在JS中比较重要又比较独特的对象--Event对象以及应用。 －简单介绍JS－ 谈到javascript，很多人(比如我)总想探究一下它和Java的关系，其...
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生物信息系列：根据成对bed文件以及多个BigWig文件画出信号图
引言：本期文章是记录一下如何利用一对bed文件以及多个BigWig文件提取信号值并进行画图的实现过程。 Materials：两个bed文件，多个ENCODE数据库下载的组蛋白...
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pandas用法归纳＋简单的文件处理命令
古人云：温故而知新。最近把pandas的一些常用的方法以及一些处理文件的常用命令用法总结了一下，因为再不复习就真忘了。 01 — pandas Q1:有时候列数很多，不可能手...
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HTML5之localStorage实现“是否保存密码”
“ 最近学习了一下关于web应用的本地储存，一个简单的例子就是平时在登陆界面的“是否保存密码”，所以主要列出实现的脚本以及学习中遇到的问题” 背景： 本地存储：包括web-S...
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HTML <label> 标签<label> 标签的作用 在HTML中 标签不会向用户展示任何特殊内容,它的作用是把自己与其他标签"绑定"起来，也可以说是与其他元素关联到一起，粗暴点说就是 有一腿。 与其...
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HTML <label> 标签
<label> 标签的作用 在HTML中 标签不会向用户展示任何特殊内容,它的作用是把自己与其他标签"绑定"起来，也可以说是与其他元素关联到一起，粗暴点说就是 有一腿。 与其...
