背景 目前市面上的肿瘤靶向用药基因检测Panel已非常常见，除了直观层面的gene种类、数目、捕获建库方法的不同外，对于肿瘤panel， 探针定制之初相关的MSI位点、...
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NGS基因检测Panel的探针设计 -
sanger测序结果分析
这个知识来之https://mp.weixin.qq.com/s?src=11×tamp=1601291787&ver=2612&signature=w3900vK...
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WGCNA实例分析及解读（附代码）WGCNA分析基于两个假设：1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路，2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点，可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...
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转录因子详细介绍(motif)TF: transcription factor转录因子TFBS: transcription factor binding site转录因子结合位点TFBS是序列内的loc...
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Motif和domain的区别Protein domain： 结构域的概念由Wetlaufer于1973年首次提出，他定义结构域为可以自动折叠的稳定的蛋白质结构单位。过去，结构域被描述为，折叠单位，致密结...
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转录组数据库的基本使用（一）-GO数据库转录组数据库的基本使用（一）-GO数据库 转录组数据库有哪些？ 目前在对转录组数据进行分析的时候，很多测序公司通常使用以下数据库： GOhttp://www.geneonto...
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[转录组] 生物学重复到底设定多少个合适
我打算做一个RNA-seq项目，研究一株细菌在两个环境条件下的表达差异。现在，我打算确定生物学重复的个数，以便可以得到统计学上有意义的结果。我打算每个环境的样本设置两个生物学...
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可变剪切软件CASH测试
可变剪切介绍： 什么是基因的可变剪切？ 有些基因的前体mRNA（pre-mRNA）通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点）产生不同的mRNA剪接异构体，这一过程称为可变剪接（...
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【如何提问】以我最近的一次提问为例
只要开始学习，就会出现疑问。即便一个作者认为自己讲的多么具体，但是由于“知识的诅咒”存在，必然有一些点是他认为理所当然，但是读者/听众却从未听过的现象。譬如，之前在生信媛举办...
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RNA-seq的标准化方法罗列
RNA-seq的标准化方法 对于RNA-seq而言，由于 技术误差， 测序深度不同， 基因长度不同，为了能够比较不同的样本，比较不同的基因的表达量，以及使表达水品分布符合统计...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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