Cdx2是一个关键的转录因子，在小鼠肠道上皮细胞的发育过程中起着决定性的作用。它在胚胎期和成年期的肠道上皮细胞中都有表达，但其结合的基因组位点在发育和成年期有所不同。DNA甲...
发简信
IP属地：广东
-
WGBS+ChIP-seq技术揭示Cdx2转录因子在发育与稳态中的动态结合机制｜NC/IF14.7 -
宏基因组学揭示猪粪与土壤中抗菌药物抗性基因与金属抗性基因的共存及共选择机制抗菌药物被广泛用于治疗人类和动物的感染性疾病，但其过度使用导致了抗菌药物抗性（AMR）增加。细菌对几乎所有类别的抗菌药物都已表现出抗性，这引起了全球关注。抗菌药物抗性对公共健...
-
MeRIP-seq揭示ALKBH5通过m6A-YTHDC1依赖性机制影响肿瘤进展的分子通路｜Cancer Lett神经胶质瘤是成人中枢神经系统中最常见的恶性原发性肿瘤，预后极差。尽管采用多模式治疗，但复发和恶性进展是低级别胶质瘤治疗的主要难题。表观遗传调控在肿瘤发生中起着重要作用，其中m...
-
中农大曾祥芳团队WGBS+ChIP-seq揭示蛋氨酸在母胎免疫耐受和子宫内膜容受中的表观调控机制｜Cell Rep母胎免疫耐受是指母体免疫系统对胎儿抗原的耐受，避免对胎儿产生免疫排斥反应。子宫内膜容受性是指子宫内膜接受胚胎着床的能力。子宫内膜容受性和母胎免疫耐受是成功妊娠的两个关键过程。...
-
Plant Physiol：郑州果树所王力荣团队ChIP-seq等揭示桃树需冷量和芽休眠调控的关键基因桃树（Prunus persica）等多年生果树的芽休眠是其冬季生存的关键策略，需冷量（chilling requirement，CR）是打破休眠的必要条件之一。然而，全球变...
-
m6A-seq+RNA-seq揭示KRAS突变通过调控ALKBH5翻译后修饰导致肺癌对铂类药物耐药｜JCIKRAS基因突变在非小细胞肺癌（NSCLC）中非常常见，尤其是KRAS G12C、G12V、G12D等突变类型。这些突变通常导致KRAS蛋白处于持续激活状态，促进肿瘤发生和发...
-
RNA甲基化修饰和R-loop的交叉调控：从分子机制到临床意义｜深度综述R-loop（RNA-DNA杂合结构）是转录调控、DNA复制和修复等关键细胞过程的重要组成部分。但R-loop异常积累可能会破坏基因组完整性，从而导致多种疾病的发生。越来越多...
-
ChIP-seq+DRIP-seq揭示AMPK通过调控H3K4me3沉积和R-loop形成以维持基因组稳定性和生殖细胞完整性｜NAR在饥饿等能量胁迫条件下，生物体会通过调整基因表达和代谢来适应。AMPK（AMP激活蛋白激酶）是一种高度保守的代谢主调控因子，能够感知能量水平的降低，并在饥饿等应激条件下合理分...
-
微量WGBS+ACE-seq揭示卵巢早衰的人卵丘细胞DNA甲基化与羟甲基化表观基因组图谱早发性卵巢功能不全（Premature ovarian insufficiency，POI）（亦称卵巢早衰），是指女性在40岁之前卵巢功能下降，表现为促性腺激素水平升高和雌激...
-
深度综述：mRNA m5C修饰的鉴定、效应分子、分子机制及其生理病理功能｜Int J Biol Sci5-甲基胞嘧啶（m5C）是一种在转运RNA（tRNA）和核糖体RNA（rRNA）中广泛存在的核酸修饰，同时也在转录组中广泛分布，是真核生物信使RNA（mRNA）的内部修饰之一...
-
MeRIP-seq揭示METTL3-METTL14特异性重编程m6A RNA甲基化修饰并促进肿瘤进展｜Sci AdvN6-甲基腺苷（m6A）是mRNA上最常见的化学修饰之一，对基因表达调控至关重要。METTL3和METTL14形成的异二聚体复合体（METTL3-METTL14复合体）是mR...
-
浙大范衡宇团队acRIP-seq揭示哺乳动物mRNA乙酰化修饰ac4C形成的分子机制｜Adv ScimRNA中存在大量的修饰碱基并塑造了表观转录组，mRNA修饰在RNA代谢和转录后调控中发挥着关键作用。其中N-4-乙酰胞嘧啶（ac4C）是唯一已知的RNA乙酰化修饰。ac4C...
-
易基因：中国科学院孔庆鹏团队利用WGBS揭示长寿男性特有的DNA甲基化修饰机制/表观遗传时钟｜Cell Rep男性通常比女性寿命短，但长寿男性（long-lived men，LLMs）往往表现出更好的健康状态，包括良好的身体表现和较低的癌症风险。这种现象表明男性可能存在一种特定的长寿...
-
RRBS揭示中药材滇重楼DNA甲基化变化及花粉调控种子休眠的表观遗传机制滇重楼（Paris polyphylla var. yunnanensis）是一种著名的中药材，其花药在花粉成熟后表现出独特的周期性开裂和闭合的生理特性。其种子具有“次生休眠...
-
ACE-seq助力开发EDD-5hmC检测新技术用于疾病诊断研究中精准定量5-羟甲基胞嘧啶表观遗传修饰在多种生物和病理过程中起着关键作用，其中5-甲基胞嘧啶（5mC）被认为是肿瘤发生和进展的早期分子事件，并已成为一个非常有前景的生物标志物。近年来，5-羟甲基胞嘧啶...
-
微量转录组测序揭示槟榔碱、咖啡因和尼古丁对神经系统转录水平的作用槟榔、咖啡和烟草的主要活性成分分别为槟榔碱（arecoline）、咖啡因（caffeine）和尼古丁（nicotine），这些物质通过影响中枢神经系统产生不同的生理效应，但目...
-
DNA甲基化、RNA甲基化（m6A/m5C）、ChIP-seq、单细胞转录组、宏基因组｜项目文章精选DNA甲基化研究 （1）RRBS项目：DNA甲基化+转录组等多组学分析揭示IDH1-R132H突变加剧顺铂诱导肾毒性 期刊：Cell Death & Differentiat...
-
Nature子刊：RRBS等揭示IDH1-R132H突变通过DNA甲基化加剧顺铂诱导肾毒性｜项目文章顺铂（cisplatin）是一种广泛使用的化疗药物，但其使用常伴随着包括肾毒性在内的多种副作用。急性肾损伤 （Acute kidney injury，AKI）是与顺铂治疗相关...