SingleR 教程网址（https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/SingleR/inst/...
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【单细胞】SingleR注释细胞类型
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技术 | 单细胞转录组测序之Smart-seq2Smart-seq2 Smart-seq是由路德维格癌症研究所的 Rickard Sandberg实验室[http://sandberg.cmb.ki.se/]所开发的一套在...
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单细胞转录组数据分析||Seurat3.1教程:Interoperability between single-cell object formats本节，我们演示了在Seurat对象、singlecellexper对象和anndata对象之间进行转换的能力。以建立Seurat与其他单细胞数据分析工具之间的链接。 Seur...
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scanpy分析单细胞数据R在读取和处理数据的过程中会将所有的变量和占用都储存在RAM当中，这样一来，对于海量的单细胞RNA-seq数据（尤其是超过250k的细胞量），即使在服务器当中运行，Seura...
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可以用awk将剩下三列信息手动添加上去，第四列是基因名字，可以自己先任意命名，或者参照基因组注释。第五列就用“.”代替就行。第六列表示正负链信息，不重要的话就都标成“+”吧。参照命令：awk -v OFS="\t" '{print $1, $2, $3, "Gene", ".", "+" }' your.col3.bed > new.col6.bed
【生信】格式转换：转成bed及bed12格式
基因组注释gtf文件或bed6文件转bed12文件 上一篇详细介绍了bed格式，尤其清楚的解释了bed格式中的最后三列，这三列对于理解bed12格式转换至关重要。 本文主要介...
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教你用科学杂志喜欢的配色作图——R包ggsci
ggsci是ggplot的主题包，它提供一系列高质量的调色板，其灵感来自于科学期刊、数据可视化库、科幻电影和电视节目中使用的颜色。ggsci中的调色板可以作为ggplot2s...
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2019-06-09
R的安装还是很简单的，在cran上找到下载连接,然后下载安装包就好了。同样，安装后续的Rstudio也是如此。将两个软件都安装好后，试着在Rstudio里安装第三方的Libr...
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单细胞转录组||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jianshu.com/p...
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Linux下的并行神器——parallel
GNU Parallel是一个shell工具，为了在一台或多台计算机上并行的执行计算任务。本文简要介绍GNU Parallel的使用。 1、parallel 用法简介 1.1...
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PPT VBA 的学习笔记
PPT VBA 与 Excel VBA 的对比 掌握 VBA 并不是一门业余爱好，而是一种工作能力，才成为职业安全的保障。同时，现代企业业务对 VBA 的解决方案需求巨大， ...
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endnote 第100行缩进变宽解决办法检查毕业论文时，发现一个问题，endnote加入的参考文献：第100个参考文献，编号和参引文字之间距离变宽，如下： 百度了一下，没有找个合适的方法，于是自己研究了一下Endn...
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R使用笔记: ggplot2做boxplot的几个细节本次笔记内容：fill =的位置： ggplot(aes(fill = )) & geom_boxplot(fill = ) & geom_boxplot(aes(fill ...
