单细胞GSEA分析需要的文件有两个：1. 单细胞基因表达变化数据（两列，一列是geneid/gene symbol，一列是logFC）（文件格式：.rnk）2. 目标基因集（...
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单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程 -
使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十四章)本文首发于我的个人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顾: 使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章) 使用ArchR分析单细胞ATAC-...
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使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十二章)本文首发于我的个人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顾: 使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章) 使用ArchR分析单细胞ATAC-...
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使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第十章)本文首发于我的个人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顾: 使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章) 使用ArchR分析单细胞ATAC-...
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单/多个基因在组间同时展示的多种选择：分组小提琴图、分组/分面柱状图、单基因蜂群点图拼图绘制这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】：基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文目录 【ggplot2绘图具体...
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单细胞CNV分析——inferCNV 结果再挖计算每个细胞的CNV score或者判断每个细胞是否是癌细胞 文献《Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heteroge...
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基于单细胞测序的蛋白活性推断（PISCES）分析流程笔记，凎！
写在前面 感谢califano-lab[https://github.com/califano-lab]团队将代码无私的分享出来=。=！ 本流程需要一点点R语言与linux基...
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相关性分析 | R语言 -- 相关性矩阵及可视化感谢各位简友一直的关注。 请关注：感谢陪伴[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MjY2NTA2Nw==&mid=2247483891&...
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简书笔记汇总
以下是我简书里所有的文章链接，按不同的专题分类，方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Linux命令行与shell脚本编程...
