Revealing the Immune Heterogeneity between Systemic Lupus Erythematosus and Rheumatoid ...
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基于免疫库构建和单细胞数据揭示 SLE 和 RA 之间的异质性 -
用R语言进行相关性分析：画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值一. 读取数据 因为我们一般自己录的数据都是excel表格的，对于读取excel，此处有一个小技巧 读取excel方法 1.把excel文件另存为CSV文件 2.按照读取cs...
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@c30161d42d70你好，我也遇到了这个问题，请问解决了吗？如何解决呢？
决策曲线(Decision Curve Analysis)的绘制(R语言)
本文案例数据是NHLBI（美国国家心肺血液研究所）著名的Framingham心脏研究数据集的一个子集。大概长这个样子： 代码实现： 1.1 绘制决策曲线(Decision C...
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7.R语言logistic回归临床预测模型-Calibration校准曲线以下内容来自B站up主：大鹏统计工作室[https://space.bilibili.com/521800630] 的系列教学视频《R语言Logistic回归临床预测模型》第...
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GSVA富集分析小注意点在制作如下图的图形时，如果最后用ComplexHeatmap函数作图，当需要用HeatmapAnnotation函数添加Group时，记得先对Group进行排序，把脚本中相同...
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R escape包使用 2021-12-29安装说明 escape是BiocManager中的一个库包，当前版本 v1.4.0 (2021-12-29) 只有R 4.0能够安装， 由于平时使用的分析电脑没有升级，还是R...
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随机森林与人工神经网络联合诊断心衰模型的构建与分析
今天，和大家分享一篇生信文章的解读与复现——随机森林与人工神经网络联合诊断心衰模型的构建与分析。 Part1文献解读 1摘要 心力衰竭是一个全球性的健康问题，影响到全世界约 ...
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longer object length is not a multiple of shorter object length
整理一个warning，一开始以为是普通的警告不以为然，后面发现是一个错误，直接导致运算结果不同提取rt中4、5字符等于02,03,04的列原代码： 使用原代码提示longe...
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R语言ggplot2画漂亮的环形柱形图的一个实例在twitter上看到一个图 配色很漂亮，代码和数据也是公开的，今天的推文来学习一下他的代码 代码来源的链接是 https://github.com/NearAndDista...
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单细胞转录组测序揭示了动脉粥样硬化免疫细胞的异质性
动脉粥样硬化中的免疫细胞包括 T、B、NK 和 NKT 细胞、巨噬细胞、单核细胞、树突状细胞、中性粒细胞和肥大细胞。单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术的进展使我们对免...
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R语言ggplot2作图一些好看的颜色搭配这些颜色来自于网页链接 https://www.royfrancis.com/elegant-scientific-graphs-learning-from-examples...
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10X单细胞转录组下游流程-3-亚群注释1. 读取数据 2. 按时间点分组画图 可以看到每个群中基本都有四个时间点的细胞 3. 标识感兴趣的基因 4. 亚群注释 5. 不同时间点分开画图
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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R语言可视化及作图3--图形颜色选取R语言绘图系列： R语言可视化及作图1--基础绘图（par函数，散点图，盒形图，条形图，直方图）[https://www.jianshu.com/p/9bb8810df75a...
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R语言msigdbr包提取基因集
首先查看可供选择的物种信息 使用msigdbr()函数可以得到想要的基因集，其中category参数可以指定基因集的类别，比如“H”或者“C1” 之后可以利用split函数把...
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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GSEA富集分析基本概念 Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)是一种的计算方法，用于评估在一个预设订的基因集中，两个生物学数据集间，是否存在统计学上显著且一...
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AUCell：计算单细胞转录组的每个细胞中特定基因集的活性程度AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集（如gene signature,gene module）的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...
