为啥我用的winLength单位是bp，最后结果也是bp。
生信分析20：基于重测序数据计算重组率在基因组上，重组率并不是均匀的。这篇大豆的文章通过高密度的芯片数据绘制了大豆全基因组的重组图谱，结合转录特征以及各种表观修饰特征，探索了重组与基因表达以及各种表观修饰的关系。...
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使用gatk进行SNPCalling及下游分析（BSA等）
1 二代数据过滤（现在二代数据质量较高，可不过滤） 使用fastp过滤，参数默认 fastp -w 30 -i ${i}_1.fq.gz -I ${i}_2.fq.gz -o...
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Word和WPS插入和修改目录1 Word插入目录 以上面格式为参考： 在Word中首先要对确定每一章标题的大纲级别 1 将光标放置在第一章的位置，右键段落，选择大纲级别，改为1级，后面的小结依次改为2级...
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利用Verkko组装基因
Verkko是一款能够对HiFi和ONT数据进行混装的工具，是一款可以用于T2T组装的工具。 1 Verkko安装比较简单，利用conda可直接安装 conda instal...
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计算多个突变体中突变基因（并集）的数目
#计算突变体中的pan基因 import sys from itertools import combinations input1 = open(sys.argv[1],'...
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测试了只用hifi数据进行组装，感觉组装效果不是很好
用verkko组装基因组
背景介绍 verkko是一个最新的可以应用于二倍体基因组T2T（telomere-to-telomere）级别的基因组组装的组装软件。 2022年9月14号李恒在主题为Pac...
