Abstract： 统一流形逼近与投影(UMAP:Uniform Manifold Approximation and Projection)是一种新的降维技术，其理论基础是...
发简信
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论文笔记：UMAP: Uniform Manifold Approximation and Projection for Dimension Reduction -
DEGseq
DEGseq[https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/DEGseq/inst/doc/DEG...
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[数据库] 肿瘤位点相关数据库肿瘤研究相关数据库： 最经典的Cosmic数据库COSMIC 全称：Catalogue of somatic mutation in cancer 解读用COSMIC dri...
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ANNOVAR结果说明-SNP/INDEL
一 结果文件说明 1 VCF (Variant Call Format)是储存Variation结果的文件格式 该文件的#列为文件的详细解读信息 2 *.hg19_mul...
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如何投递任务、监控任务和终止任务；(user)现有的新服务器上运行程序一定要进行任务投递，将程序交由任务管理系统统一调度 现有的新服务器上运行程序一定要进行任务投递，将程序交由任务管理系统统一调度 现有的新服务器上运行程...
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我到底该用什么统计方法？开篇废话不多说，先上图吧。 惊！19道题测出你该用什么统计方法（强行标题党一发。。图片看不清可以选用如下方法）： 1.有几个因变量？ A.一个 转到第2题...
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还在封装，封装好了会分享出来
24nt siRNA与甲基化关联分析
简介：small RNA测序分析结果 与 WGBS测序分析结果 联合分析 1.全基因组层面 全基因组上固定bin长，统计每个bin平均甲基化水平（CG、CHG、CHH）与该b...
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[DNA-Seq] 全外显子高级分析1. 基于变异有害性的筛选 base on the sample.vari.hg19_multi 1）突变位点筛选 FREQ(1000G_ALL) < 0.01 keep: ...
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你好，请教下『第二行及以下为每个样品的名称及snp的具体内容』 这里的snp的具体内容是指 VCF文件中「ALT」列是么 ~~
SNP数据构建系统进化树
大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法吧。 1.构建进化树的算法 构...
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ChIP-Seq/ATAC-Seq/DNAse-Seq的一站式质量控制和分析流程这两天在总结标题中三种组学方法的分析流程，看到了ENCODE在去年公开的分析流程，感觉像捡到了宝贝一样。一个分析流程是针对ChIP-Seq的，包括转录因子和组蛋白修饰，链接在...
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如何通过CHIP-seq分析鉴别基因启动子和增强子
一、表观遗传学的组蛋白修饰 染色体一个核小体由两个H2A，两个H2B，两个H3，两个H4组成的组蛋白八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成。组蛋白有很多修饰形式，包括组蛋白...
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一个爱做美食的妈妈，偶尔也会和大家分享故事。坚持图原创，文原创，故事原创！未经许可，不允许转载。我已加入“维权骑士”（rightknights.com）的版权保护计划<br>微信公众号：山青青讲故事
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小作者一枚，兼职商业培训，混迹世间，无需标榜 不被定义。
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