武汉影子基因

国家肉牛牦牛产业技术体系岗位专家雷初朝教授与吕文发教授团队在《Science Bulletin》发表题为“Recent selection and introgression...

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随着国产化替代浪潮加速推进，武汉影子基因科技有限公司（以下简称“影子基因”）携手华大智造，以自主核心技术为引擎，开启基因组育种国产化新征程，为农业育种领域注入强劲动力。 影子...

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四川农业大学李明洲教授团队在《Advanced Science》上发表了题为“BuildingHaplotype-Resolved 3D Genome Maps of Chi...

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01 IFmut简介 IFmut 全称 Integrated Functional Mutation platform, 是一个潜在的基因组功能变异的数据库。 该数据库包含了...

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近日，华中农业大学动物遗传育种团队在国际权威学术期刊《Nature Communications》上在线发表了题为“EXPERT expands prime editing ...

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今天分享的内容是在2024年5月16号在期刊《Nucleic Acids Research》（IF=16.8）上发表的“ChIP-Atlas 3.0: a data-mini...

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选种和选配是动物遗传改良最重要的两个部分，选种用于遴选优秀个体，选配则用于确定优秀个体之间的配对，选种和选配二者相辅相成，选配验证、巩固选种，选种加强选配。 生产实践中，以猪...

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性状的形成受到遗传和环境因素的相互作用。因此，个体的性状表现是遗传和环境因素共同作用的结果，环境的变化往往会导致性状表现的变化。在进行选种时，某一环境条件下选择出来的优秀个体...

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在生产实践中，对于窝产仔数、精子活力与密度等性状，需要对不同胎次或在不同的采集时间进行多次记录，获得同一个体的多个观测数据，进而构建重复记录模型进行遗传参数估计。HIBLUP...

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近年来，随着整体生活水平的不断提高，人们对粮食特别是蛋白的需求量在不断增加。大豆作为主要的油料作物和经济作物，是人类以及饲料的主要蛋白质来源之一。但由于我国的可用耕地面积不足...

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在育种实践中，当多个不同目标性状受到共同基因影响调控时，多性状模型可以将性状之间的遗传相关信息考虑在内，相比单性状模型，进一步提升了遗传评估准确性。当然，多性状模型相比于单性...

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数量性状的重复力、遗传力和遗传相关等群体遗传参数是畜禽的重要遗传特性，可以由方差、协方差计算而来。而方差组分的真值无法直接测量，只能通过个体及其他亲属的表型值等信息结合适当的...

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主成分分析（Principal Component Analysis，PCA）是一种用于数据降维的统计方法。利用正交变换，将原始数据变换到一个新坐标系统，将一组可能存在线性相...

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近交系数(inbreeding coefficient)是指某一个体（二倍体生物）任意等位基因座上的两个等位基因来自父母共同祖先同一基因的概率。 亲缘系数(relations...

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基因组遗传变异按照变异的长度可分为：单核苷酸变异（single nucleotide polymorphism, SNP）、短的插入和缺失（InDel, 长度小于50 bp）...

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1、不同类型个体间关系矩阵的构建 个体关系矩阵（Relationship Matrix）用于构建遗传随机效应各变量间的方差协方差，是线性混合模型的必要元素之一。HIBLUP可...

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中国“十四五规划”提出种业振兴总目标：种业科技自强自立，种源自主可控。习近平总书记在海南考察时也说到：“中国人的饭碗要牢牢端在自己手中，就必须把种子牢牢攥在自己手里。要围绕保...

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1、计算等位基因和基因型频率 通过hiblup -h查看帮助可以检索到等位基因频率和基因型频率计算的相关参数--allele-freq和--geno-freq。 1.1、计算...

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一、HIBLUP下载 使用HIBLUP软件首先需要进行软件的下载和安装，在HIBLUP官方网站的Download页面下提供了适用于Linux、MacOS、Windows、和K...