公众号：误入BioInfor的大黄鸭
发简信
IP属地：上海
-
-
10X空间转录组轨迹分析之SPATA大家好，这一次我们来分享一下有关做10X空间转录组的分析软件SPATA，其实关于10X空间转录组做轨迹分析的文章之前分享过一个，文章在10X空间转录组的轨迹分析[https:...
-
10X空间转录组的轨迹分析我们做过单细胞的童鞋们来说，轨迹分析并不陌生，然而如果将单细胞的轨迹分析结果运用到空间转录组上，就可以帮助我们了解到细胞随着时间进行的过程中，细胞位置的迁移。其中最常用的方式...
-
-
10X空间转录组数据分析之空间细胞密度hello，大家好，今天礼拜天，天津雾霾严重，呆在家里学习一下吧。今天给大家分享的是空间转录组的空间细胞密度的分析，这个分析非常重要，下面是一张展示图。 大家应该都有基本的常...
-
10X空间转录组数据分析梳理hello，周四了，时间怎么过的这么快呢？？我的记忆还停留在刚过完年拔充电线的那一刻，时间啊，慢些吧，想静静的感受一下生活的美好，虽然生活总是打击我们，但我们还是要拥抱生活，...
-
10X空间转录组分析之空间模式与共定位hello，大家好，又是周五，一周又将过去了，时间总是匆匆，片刻不停留，我们唯一能做的，就是在时间流逝的过程中，留下点印记，虽然我们穷，找不下对象，但是过的开心也是成功~~~...
-
超全总结--单细胞+空间转录组的整合分析方法总结这一篇我们做一个详细的总结，周五了，疫情还没结束，父母也都老了，有时候真的感觉身为儿子实在不孝，常年在外，回家很少，家里有点事父母也不会跟我这个儿子说，小病小灾的也舍不得去医...
-
10X单细胞空间联合分析方法论hello，又是一周，周二了，最近事情很多，所以祝大家生活快乐，我们来继续看一下10X单细胞空间联合分析的内容，参考文献在Benchmarking spatial and s...
-
10X空间转录组的注释流派作者，追风少年i~ 高考第二天，去看了一下在今天高考的数学卷子，惊奇的发现最后的压轴题自己还会做，😄 ，大家不妨试一试，题在下面 以前学数学的时候总是觉得生活中根本用不到，买...
-
-
10X空间转录组数据分析之细胞的空间依赖性作者，追风少年i hello，大家好，周五了，马上大家就可以过一个美好的礼拜天了，不过现在还是工作的时间，今天分享一个分析细胞类型空间依赖性的代码，分析的结果如下图所示： 谈...
-
10X空间转录组数据推断基因拷贝数畸变（copy number aberrations）CNA在空间转录组之前，我们可以利用单细胞数据进行推断CNA，用到的软件就是inferCNV，至于inferCNV的原理，我们这里就不详细叙说了，大家可以看文章InferCNV: ...
-
10X空间转录组数据分析之CNV事件的spatial landscapehello，大家好，今天我们来分享一个新的内容，CNV事件的空间图谱，其中关于10X空间转录组进行CNV事件分析的内容，之前都分享过，文章在10X空间转录组数据分析之思路总结...
-
-
10X单细胞（10X空间转录组）肿瘤数据分析之肿瘤进化树作者，追风少年i hello，大家好，新的一周，新的开始，脑海里浮现周星驰的一句台词，只有越来越强大，才能越来越童话。 今天我们简单来学习一个简单的内容，肿瘤进化树，先看示例...
-
利用空间转录组学揭示良性和恶性组织中的细胞拷贝数变异作者，Evil_Genius 隔离的第三天，真的是让人无语，没事非要隔离干什么。 今天我们继续回顾有关空间CNV的分析，CNV的分析我写了很多，包括原理，方法与可视化，列在下...
-
10X空间转录组的文献思路简单分析作者，追风少年i 七夕马上就要到了，古人描写七夕的诗句很多，不过小时候背的就记得一首 迢迢牵牛星，皎皎河汉女。纤纤擢素手，札札弄机杼。终日不成章，泣涕零如雨。河汉清且浅，相去...
-
细胞注释之marker列表
最近一段时间更新的少，是因为自己搜集经典marker的工作接近尾声了，所以花了比较长的时间整理和总结，我自己拿了几个数据测试了一下，基本上效果不错，用搜集到的marker配合...