绘图过程反复出现Error in grid.Call(C_textBounds, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y, : polygon...
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2021-05-25_R 绘图中字体问题
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简单直观地理解非负矩阵分解NMF我对NMF的理解是一个反反复复的过程，时懂时不懂，因此在这里简单记录下我目前清醒的认知。 NMF的基本思想可以简单描述为：对于任意给定的一个非负矩阵A，NMF算法能够寻找到一...
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单细胞笔记5-tSNE和UMAP降维 降维顾名思义就是把数据或特征的维数降低，一般分为线性降维和非线性降维，比较典型的如下： 线性降维：PCA(Principal Components Analysis)、...
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tSNE和UMAP的区别
这一篇是我的学习笔记，先附上学习链接：https://mp.weixin.qq.com/s/qkbc1vz-ERHzGp8gfLiVsg 首先，这是两种降维的scRNA-se...
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R数据分析 利用dplyr包将已有的数值列转换为百分数列
数据分析中, 我们有时候会有这样的需求, 比如将已有的数值列,转化为百分位列。 Case study1: 比如说我们有如下表格，代表了ATGC四种碱基的绝对个数。 我们现在想...
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Python单细胞复现2022||03-多样本整合分析单个样本分析接上一篇：Python图文复现2022||02-数据介绍与下载[https://www.jianshu.com/p/51e49633a2a7]，结合视频观看效果更...
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Seurat对象、SingleCellExperiment对象和scanpy对象的转化Seurat官网：https://satijalab.org/seurat/articles/conversion_vignette.html[https://satijal...
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初学SingleCellExperiment对象SingleCellExperiment是通过SingleCellExperiment包创建的单细胞数据分析对象，已有几十个单细胞R包支持。其衍生自SummarizedExp...
