刘大帅1

TCGA数据库中含有的癌症名称，简写和中文名称 Abbr英文名称中文名称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌BLCABladder Urothe...

刘大帅1

有时候需要将得到的临床数据画出生存曲线进行生存分析。则需要用到以下代码

刘大帅1

rm(list=ls()) Version info: R 3.2.3, Biobase 2.30.0, GEOquery 2.40.0, limma 3.26.8 R sc...

刘大帅1

title: "火山图" author: "刘大帅" date: "2019/8/12" output: html_document 火山图事实上是一个以logFC为横坐标，...

刘大帅1

通过r语言将基因探针的id转换转换成对应的基因

刘大帅1

当对数据库中的芯片进行id转换后有许多NA值，这时候需要将这些数据值删掉。 缺失值处理包括两个步骤，即缺失数据的识别和缺失值处理。在R语言总缺失值以NA表示，可以使...

刘大帅1

https://app.grammarly.com/可以改正语法或者用1check

刘大帅1

read.table()函数是R最基本函数之一，主要用来读取矩形表格数据。 我之前处理出来的数据直接就是用的save函数来保存的，结果都是一些乱码，经过高人指点以后，发现直接...

刘大帅1

该网页并不提供一个点对点的分析，而是把一些显著相关的基因显示出来提供参考。它是从整个癌症系列来进行分析的。在这个网页得到的数据可到前面介绍的xena网站重复一下。可以作...

刘大帅1

如果你不懂代码，不懂网站规则，那么最简单的就是UCSC+xena+浏览器啦！！！https://xenabrowser.net/全部根据癌症种类整理好了，直接点击链接即可下载...

刘大帅1

推荐一个Hmisc包 下载好后使用#res=rcorr(as.matrix(rt))#这个函数可将rt列表中的任意两个基因展示相关系数与P值 cormatrix=functi...

刘大帅1

rm(list=ls()) library(ggplot2) library(sf) library(cowplot) library(biscale) head(stl_r...