轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析(Pseudot...
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该图来源于文章:Phenotype molding of stromal cells in the lung tumor microenvironment | Nature ...
⭐⭐⭐本文记录我使用PsRobot的psRobot_tar模块识别靶基因的过程。踩了不少坑,供实验室师弟师妹们借鉴学习。本文参考: PsRobot: a web-based ...
想对数量性状表型进行定位,首先应该知道有多少QTL存在,其次QTL之间是否存在互作,当 QTL数目和其互作关系确定后,就可以估算其对表型变异的解释百分比(PVE:percen...
pheatmap参数: 网上有针对热图绘制的粗略讲解,但是都是参数不完整,可能不能满足所有人需求,于是手动整理了热图的全参数介绍。 mat 数组矩阵(要绘制热图的数据源,保证...
本期介绍一个控制热图颜色范围并规定指定值颜色的小技巧。 使用的是R语言的pheatmap包,先生成随机数据: data1如下: 查看数据范围: 使用上面的矩阵做热图,要求低值...
本次内容在pheatmap热图绘制——基础篇的基础上展示如何在热图上体现不同的功能分区,以及如何根据聚类结果将不同的cluster分开? 首先清除环境,安装并加载所需要的R包...
前一篇推送解读了今年发在NG上的鉴定玉米抗旱基因的文章。文章中一个比较关键的分析是从泛基因组水平鉴定结构变异。作者应用并评估了四款常用的软件:SyRi、Smartie-sv、...
虽然没有几个关注,但能看到这些笔记的应该都是同志们 有时候朋友的私信我可能看不到,我也不一定能解决。 群体遗传学方面、生信方面、R语言等等,如果大家有什么问题,可以在这边留言...