SNP&InDel: missense: 错义突变nonsense: 无义突变frameshift: 移码突变splice-3: 剪切突变splice-5: ...
发简信
IP属地：江苏
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变异位点注释描述
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Bioinformatics Workbook：一个生信学习网站 | 不需要翻 | 示例数据+代码> 推荐一个生信学习网站：`Bioinformatics Workbook` > 网站地址：https://bioinformaticsworkbook.org/[https...
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理论上说，每个B细胞只有一个BCR，对应一条重链（IGH），1条轻链（IGK/IGL），也就说，只要有IGK/IGL的任何一个基因，都应该存在一个IGh基因，dimplot应该全是IGH的颜色，但是按照文中的整合方法，其实已经丢失至少一半的重链或轻链基因，所以dimplot的IGH，IGL，IGK呈现分群的结果，个人认为应该根据barcode把同一细胞的IGH/IGK/IGL分成三列加入seurat的meta中，这样应该可以对应上
单细胞免疫组库数据分析||Seurat整合单细胞转录组与VDJ数据
在做10X单细胞免疫组库分析的是往往是做一部分BCR、TCR做一部分5‘转录组，那么怎样才能把两者结合到一起呢？ 今天我们尝试用我们的趁手工具做一下整合分析。 首先是下载数据...
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@薇薇儿_9aa8 感谢指正👌
NGS006 illumina测序
illumina平台杂交捕获流程介绍 NGS流程（以Nanodigmbio的杂交捕获方案为例） 建库原理介绍 建议此部分可以参考一些文献及商品化试剂盒进行了解 片段化 DNA...
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@丁允鹏 上游就是从fastq到拿到表达矩阵，然后下游就是从表达矩阵到差异分析，GO/KEGG等，上游对内存和CPU要求较高，下有分析主要是R语言，16G笔记本可以的
单细胞转录组基础分析(1)：分析环境搭建
以下内容部分引用自 生信会客厅[https://mp.weixin.qq.com/mp/profile_ext?action=home&__biz=MzIyMzMwNDQ2M...
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SingleR的内置数据集怎么下载到的呢，我下载的时候，总是报错dplyr不兼容
学习对scRNA-seq数据注释的R包SingleR
Using SingleR to annotate single-cell RNA-seq data 参考：https://www.bioconductor.org/pack...
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2019.8月中旬开始系统自学生信，<br>自学路漫漫索性报个班。<br><br>生信技能树真的很棒！<br><br>这是我的一个学习笔记平台，点滴记录。
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文中第五部分已经列出各方法的对比及应用，所以应根据自己的实验目的综合考量，不同的应用场景，对方法的选择是不同的
全基因组扩增方法汇总
全基因组扩增技术（Whole genome amplification，WGA）能够实现对整个基因组的扩增以提供大量可供分析样品的技术 1.基于PCR 技术的WGA 方法 1...
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R.004 安装及使用R包install.packages(“package_name”): Install a packagelibrary(“package_name”): Load and us...
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R.003 Rstudio使用安装R和RStudio之后，现在的问题是如何开始使用R / RStudio。 在本文中，我们将介绍如何运行RStudio以及设置工作目录。请注意，可以在RStudio的内部或...
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单细胞转录组基础分析(1)：分析环境搭建
以下内容部分引用自 生信会客厅[https://mp.weixin.qq.com/mp/profile_ext?action=home&__biz=MzIyMzMwNDQ2M...
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R.005 常用生信R包安装
转自生信技能树，链接详见文末 Reference 生信技能树-史上最贴心R包安装示范视频[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxO...
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Rdata006 使用stringr处理字符串
1 准备工作 加载包library(tidyverse)library(stringr) 1.1 stringr介绍 stringr包被定义为一致的、简单易用的字符串工具集。...
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Excel.006 函数学习(6) - 日期与时间
1 DATE 返回代表特定日期的序列号。如果在输入函数前，单元格格式为“常规”，则结果将设为日期格式。DATE(year,month,day) 1.1 Year YEAR(s...
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Excel.005 函数学习(5) - 数学函数1 ABS 函数 返回数字的绝对值。绝对值没有符号。ABS（number）Number 需要计算其绝对值的实数。 2 取整 2.1 ROUND 返回某个数字按指定...
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Excel.004 函数学习(4) - 统计1 COUNT 1.1 COUNT 返回包含数字以及包含参数列表中的数字的单元格的个数。利用函数 COUNT 可以计算单元格区域或数字数组中数字字段的输入项个数。COUNT(...
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Excel.003 函数学习(3) - 逻辑判断
1 IF 函数 IF函数是最常用的判断类函数之一，能完成非此即彼的判断。IF，相当于“如果”，常规用法是：IF(logical_test, value_if_true, [v...
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Excel.002 函数学习(2) - 文本处理1 LEN LEN 返回文本字符串中的字符数。LEN(text)Text是要查找其长度的文本。空格将作为字符进行计数。 2 LEFT / RIGHT LEFT 基于所指定的字...
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Excel.001 函数学习(1) - 查找与引用1 LOOKUP 函数 LOOKUP 函数返回向量（单行区域或单列区域）或数组（用于建立可生成多个结果或可对在行和列中排列的一组参数进行运算的单个公式。数组区域共用一个公式。...
