主要想介绍的是下载下来数据的数据处理这一块，不是特别建议RTCGA的下载方法，列出了是因为怕没有源文件后续数据处理看不懂 一下载数据 RTCGA下载是把所有数据一起下载下来，...
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TCGA数据挖掘一：下载数据并提取临床及表达矩阵信息：RTCGA包 -
RTCGA学习-指定基因在不同癌症的表达量学习代码引自生信技能树https://mp.weixin.qq.com/s/JB_329LCWqo5dY6MLawfEA 1.安装加载RTCGA：R包 2.指定基因HSF1从癌症...
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基于液滴的单细胞转录组测序Drop-seq：从建库到测序的介绍说起单细胞转录组，现在基本已经成为了高分文章的代名词。由于相比于基于整块组织或整片培养细胞总体RNA的bulk RNA-seq，单细胞转录组测序的分辨率提高到了单个细胞的层面...
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单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics要实现单细胞mRNA测序，需要解决2个难题：1. 一个人类细胞中，RNA总量大约只有10pg左右（1pg=10-12g），其中mRNA的量大约只有0.2pg。要把这么少的mR...
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eQTL就那样～（2）前言 我还未想到这个专题叫什么...... 暂定“XXX就那样”？ 6.GTEx数据库是什么？ “人类GWAS-转录组-疾病表型补完计划”，噢不，基因型-组织表达计划（G...
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我是外科医生，所以很粗暴的哟！～～<br>欢迎大家关注微博“医学小蛋散”哦～<br>让学医快乐～ <br>记录行医之旅～
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本人医学生一枚，目前已保送至北京协和医学院读研。<br><br>欢迎关注我的个人微信公众号：全哥的学习生涯。里面记录了关于自己医学专业上的学习经验，与本专业之外包括日语、英语以及数据分析中的重点知识汇总、学习方法与心得，当然，还有我自己的保研历程与经验、一些生活上的感悟等等。<br><br>
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如何利用R语言进行meta分析—详细教程（以OR值和 95%CI作为效应尺度进行合并）正在阅读本文的小伙伴你好，利用R语言进行meta分析是我比较重要的一次将R语言基础理论应用于实践的过程，并收获了很好的效果。这个应用也是我的毕业论文中研究方法的核心思路...
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生物信息学专业<br>公众号：生信学习手册
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R 数据可视化 —— circlize 基因组绘图函数绘图函数 创建基因组数据的绘图区域的函数是 circos.genomicTrack()，或者 circos.genomicTrackPlotRegions()。 其实用方式类...
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BIG小硕一枚<br>感兴趣生命健康大数据和各种组学分析
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circlize R包学习【持续更新中...】颜色通明度设置 列表转化成矩阵 查询当前cell的信息 chordDiagram做圈图 生成的结果图： circos.arrow 画平行于圆圈的箭头 生成的结果图： 做多个环...
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临床预测模型列线图的评估：校准曲线模型构建完成后需要对模型进行评估和验证其性能。模型预测的生存率与实际的差距有多大呢？一般是看校准曲线。例：一个模型（其C指数为0.8）评估某位患者5年复发率为70%。说明该模...
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易学统计原创公众号，专注临床统计，科研数据挖掘！
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R语言|基于Cox模型pec包深度验证转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记：R语言pec包深度验证Cox模型[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzNw...
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当在谈临床预测模型时候，我们究竟在说啥?临床资料收集： 1.提出科学问题 2.收集临床资料 3.选择合适统计学方法 4.选择合适的统计软件 5.评估结果，结合专业知识回答科学问题 这个框架真的很好用的，我在间接性残...
