写在前面 早晨起来，想起来很久很久以前，有一个用户提出的优化想法，觉得确实也合理，就更新了一下。顺便也把相关插件使用详细捋捋，方便大伙搞清楚这些插件都拿来干啥。早前，顺手写了...
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零基础教程 | 我有一堆基因，如何预测TF-Gene调控网络？ -
信息爆炸！Heatmap映射到Venn上，数据交集差集分析更高效~写在前面 前几天，高教授联系我，提及他正在开发「ggVennDiagram」第二版，问及整合成 TBtools 插件事宜。当然，我求之不可。在我们简单高效地配合下，ggVen...
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交集？靠谱？ | TBtools Venn 图上自动显示交集显著性写在前面 Venn 图功能是 TBtools 中较早的功能，支持 2~6 组的 Venn，具体可以参考推文《WonderfulVenn - 操作简便到极致的可交互的韦恩图工具...
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为了让所有人都轻松完成「基因差异表达分析」.....写在前面 在「基因差异表达」分析这件事情上，说实话，「TBtools」真的做了不少简化工作，大体如下： 做了 Rserver.plugin 做了 DESeq2 Wrapper...
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如何使用「TBtools」进行基因差异表达分析？写在前面 今天休息了一天，大体学了一下一直有想法学，但是没时间学的东西。结果就是，太难了。时间有限，还是放下。但今天还剩下三个多小时，总得做点啥。看看，似乎今天没写啥推文。于...
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插件 | 点点点，基因差异表达分析~几分钟就掌握了于是，TBtools - RNAseq 全家桶到位！ 写在前面 很久很久以前，TBtools 解决了 RNAseq 数据分析中几个常见问题： 基因功能注释，NR，SWISSP...
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教程 | 可视化 多组 基因差异表达分析 结果写在前面 最近做了一些转录组数据分析。想想，上一次这么精细地分析转录组数据，都是三五年前的事情。整个实验设计是一个器官的不同发育阶段。按照最传统的做法，不同阶段，两两间进行差...
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PheWAS(全表型组关联分析)----PheWAS的R包测试及分析(二)
由于上次写完教程一后还有许多疑问还没解决，在师兄的建议下看了一下R包中核心函数的源码(到底在做什么回归?)，大概解开了心中的部分疑惑。最近在看很多问题时候，总会有些急躁，反而...
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FPKM数据该怎么分析？
前天同事帮领导写基金，看文献找思路，突然问我能不能帮她分析一下数据，我看了一下数据是FPKM的文件。第一反应是可以。我就试试了一下。 1.数据下载 2、差异基因分析 3.如何...
