之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggplot2画了。。。其它方法简单地...
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把基因画在染色体上 -
Motif scanning tool: FIMO（在线版分析笔记）FIMO官网教程 官网：这里[http://meme-suite.org/doc/fimo-tutorial.html?man_type=web] （一）什么FIMO？ FI...
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KaKs_Calculator 3.0（2.0）的安装与使用（搭配ParaAT）1 介绍 参考文献：Zhang Z . KaKs_calculator 3.0: Calculating selective pressure on coding and n...
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转录组分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
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使用R语言将fasta转phylip格式
使用paml软件里的mcmctree功能需要phylip格式的比对结果,找了以下,发现用R包phylotools转化最方便，另外提醒一下要用mcmctree的朋友，我发现mc...
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6-【FasTtree、RAxML-NG、IQtree】的安装和使用（2021.3.16更新）初次记录时间：2021.2.5 3.12更新说明：ML建树对与模型的替代选择比较敏感，因此增加了第四部分推测最佳模型的方法：jModeltest和ProtTest。3.16更...
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基因组组装—SOAPdenovo2的使用一、简介 SOAPdenovo2是用于short-read组装的软件，能够组装出类似人类基因组大小的de novo草图。SOAPdenovo主要用于大型植物和动物基因组的组装...
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NCBI中编号/编码说明
【NCBI编号】NCBI中编号/编码说明 在日常分析中，我们在NCBI数据中常常见到AC、NC、NM、NR、NP、NG等各类编号，这类编号分别代表着怎样的含义？我们该如何根据...
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ubuntu 安装SRAtoolkit、FastQC、HISAT2、Stringtie、Trimmomatic
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