mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal！ 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的表达矩阵数据，但是无论是自身实验需要，还是从NCBI的GEO...
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mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipeline -
[R语言]boxplot绘图经验总结箱线图是统计分析里面最为重要且基础的图形，利用R语言绘制箱线图是数据分析里必不可少的一环。这里我总结了面对不同情形时，绘制箱线图的经验。 这里只介绍利用基础绘图命令boxpl...
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[R语言] Heatmap绘图经验总结热力图（Heatmap）是统计学习中不可或缺的图形之一，在生信领域中尤为常见，它通过颜色的深浅程度来判断不同类别间的差异，通常结合数据特征的相关系数矩阵来判断其显著性。此外，...
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用DESeq2对表达矩阵进行归一化的详细步骤
“清晰而又吸引人——这无疑是学习R的有趣方式！”——Amos A. Folarin，伦敦大学学院 1.对readscount进行ln()转换 表达矩阵的行代表feature（...
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R数据分析 利用dplyr包将已有的数值列转换为百分数列
数据分析中, 我们有时候会有这样的需求, 比如将已有的数值列,转化为百分位列。 Case study1: 比如说我们有如下表格，代表了ATGC四种碱基的绝对个数。 我们现在想...
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R 数据可视化 —— ggraph 边与节点前言 将网络图结构与我们平常绘制的数据图进行对比，我们可以发现，图的布局就相当于每个数据点的坐标，而节点就相当于数据点，边就是连接数据点的几何图形，可以是直线、曲线或带箭头的...
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用R中iheatmapr画交互式heatmap我之前写过一篇用R中pheatmap画heatmap这篇实践一种交互式的方法 iheatmapr参考这里：iheatmapr包：可交互的热图绘制方法——生信宝典iheatma...
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如何将柱状图y轴截断Hello,大家好，最近碰到做图需要将y轴截断，当然很多工具都可以实现这个目的，比如excel, origin,在这我们聊聊如何使用R将y轴截断。先看一下原图 现在我想将上图...
