和我交流过的人大多知道我算比较正能量的人，没事就给他们鼓励，毕竟这个世界上大部分人都喜欢打击别人，而鼓励是稀缺的资源。比如说前段时间大家就在赵丽颖拍的广告下面疯狂吐槽这个英语...
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第8周biostar handbook学习开始 -
Biostar handbook学习笔记(五)|对正则表达式和K-mers的理解
什么是正则表达式 正则表达式就是用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合，组成一个“规则字符串”，用来表达对字符串的一种过滤逻辑。 通过正则表达式可以达到如下的目的：...
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biostar handbook(六)|正则表达式和K-mers在模式匹配中的使用模式匹配中的正则表达式和k-mer 模式匹配指的是在看似杂乱无章的系统中找到符合要求的部分。比如说你想从基因组中寻找motif，转录因子结合位点，CDS, 或者检测测序结果里...
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Sanger 测序，NGS 测序，数据分析
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Biostar handbook学习笔记五-基因组测序技术原理简介
测序技术及原理比较 测序质量控制： FASTQ文件中测序Reads需要与指定的参考基因组进行序列比对，定位cDNA片段在基因组或基因上的位置。在序列比对之前，首先需要确保这些...
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Biostar handbook学习笔记四
目前学习到的关于生物数据及数据库的基本知识有： 常用数据格式:fasta, fastq, gff, GenBank 常用序列数据库:美国国立生物技术信息中心(NCBI)欧洲生...
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哪里有班长的RNAseq教程呢？
基因本体论The learning notes of the biostar handbook(3)
gene ontology 在早两个月前，按照班长的RNAseq教程，把整个流程模仿了一遍，最终得出很多差异表达的基因，可是这些基因（基因产物）到底是干什么的？对细胞、对生物...
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biostarhandboo(三)|本体论和功能分析谈谈本体论 为什么需要本体论 作为一位大学统计棉花表皮毛的苦逼生物狗，深刻体会什么叫做经验，也就是人类模式识别能力的强大和不精确性。当时的导师教我如何根据表皮毛的长短和浓密进...
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我在简书上写作找到了男朋友01 一个月前，我写的一篇文章《三岁的爱情》居然不小心在大学的朋友圈里火了一把。 图书馆原本就是书香气与恋爱气交叉的地带。要么是一个人傲游于书里的海洋，要么是与那个他同捧着书...
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Biostar handbook学习笔记二—linux常用命令的学习与使用
1.1 pwd 显示当前路径 1.2 cd 改变当前所在目录cd / cd ~ 表示进入家目录 1.3 ls 查看目录内容。ls -alh / ls -lh显示目录下文件的详...
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Biostar handbook学习笔记一在仔细学习班长的biostarhandbook(二)分析环境和数据可重复的简书文章之后，亲自实践了虚拟机下安装biostar。现记录如下： 班长提到了需要具备三项基本的生信技...
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Miniconda以及Bioconda的使用及环境配置
进入主题之前，记录一下此刻心情。今天是第一次写简书，没有接触过markdown语法。摸索了一上午，终于有点头绪，感慨万千。 对于Miniconda及Bioconda的使用，我...
