IP属地：青海
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求问，samples＜30，为啥用vst呢？
DESeq2差异分析十全大补使用笔记
写在前面：新手老菜鸟，个人心得，不足之处欢迎交流指正；写作不易，转载前请联系我征得同意，谢谢。 1.基本原理 1.1 概述 全称：DESeq2 package for dif...
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@CC_7ca0 分开做就可以了！
GEO数据集中有不同平台的数据该怎么处理2021-01-28
这样的代码是不是很熟悉？没错就是下载GEO数据集，那如果一个GEO数据集里面有2个平台或者更多呢？开始没想明白，其实很简单啊，eSet 里面包含的是列表啊，通常只有一个数据集...
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R语言入门_R和Rstudio安装与使用主要围绕以下几方面学习 R和Rstudio的简介R和Rstudio的下载及安装Rstudio新建Rproject和R脚本以及简单使用R语言几类命令响应 R和Rstudio 对...
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R数据分析：生存分析的做法和结果解释
今天给大家写写生存分析： Survival analysis corresponds to a set of statistical approaches used to i...
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大佬，请问下，TCGA数据如果画单基因的箱线图，使用t.test还是wilcox呢？
两组间差异的非参数检验之wilcox秩和检验在R中实现
在进行两组数据间的差异分析时，我们通常会想到使用t检验。但若数据不满足执行t检验的参数假设（例如数据分布不符合正态性，变量在本质上就严重偏倚或呈现有序关系），无法使用t检验分...
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请问下两个平台的话，如果要做差异，是需要按照平台不同分开做吗？
GEO数据集中有不同平台的数据该怎么处理2021-01-28
这样的代码是不是很熟悉？没错就是下载GEO数据集，那如果一个GEO数据集里面有2个平台或者更多呢？开始没想明白，其实很简单啊，eSet 里面包含的是列表啊，通常只有一个数据集...
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请问下count数据做完差异分析可以直接用count数据进行下游富集分析吗？
TCGA 数据分析实战 —— 富集分析
前言 通常，在识别完了差异基因之后，都会对差异基因进行功能富集，来获取差异基因参与的潜在生物学功能通路或生物学进程，有助于理解基因之间的作用关系以及发现基因在癌症发生发展过程...
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2022-05-0853-13 lasso回归建立模型，每次输出结果不一致的。原因：cv.glmne函数内部有一个随机分配测试集和验证集的过程。 要使的每次模型结果一直可以在该函数前设置set....
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