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这两天的任务是了解二代测序,做了个幻灯
回顾二代双端测序原理 双端测序 上样 flowcell是用于吸附流动DNA片段的槽道,测序就在此进行。lane上随机分布两种接头,p5‘(与P5互补),P7(与P7'互补),...
最近有多个朋友问我关于二代重测序数据的分析问题(clean data 到vcf),我写了一个完整的步骤如下,若你是多个样品进行分析,最好是写 循环语句,这里我仅举一个例子“s...
What are variants, alleles and haplotypes? What are variants? In the field of genetic v...
前言 在前面的一系列WGS文章中,我讲述了很多基因数据分析的来龙去脉,虽然许多同学觉得很有帮助,但是却缺了一个重要的环节——没有提供实际可用的数据来实战完成具体的流程,不能得...
写在前面 有些事情,说要做,就总要做的。Emmm,过去的几年,开展高通量测序数据分析时,常常遇到的两个问题,已经有了一定的改变: 本机硬件性能不行,现在基本都还行,主频或睿频...
写在前面 是的,最后,我选择了「一条路走到黑」~ 咱们先不管一些人如何看,东西先整出来。大体如下。 没错。从「原始测序数据」到「SNP Calling」,也就是 从 .fas...