适用于多个样本合并分群之后想要再次修改样本名称
适用于多个样本合并分群之后想要再次修改样本名称
@落英神剑_bd12 我用软件自带数据没有遇到这样的情况,所以不太清楚
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and ClusteringSCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中(GENIE3),主要是GENIE3/GRNBoost...
@校童 括号后面是转录因子作用的靶基因
SCENIC—Single Cell rEgulatory Network Inference and ClusteringSCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中(GENIE3),主要是GENIE3/GRNBoost...
@小丑先生_0514没有哦,不过画这个图只需要两列信息,一列基因,一列logFC
画一个有标签的火山图—标出显著变化的基因参考:ggplot2绘制火山图实例 还可以添加title 用点的面积表示abs(logFC)的大小
pySCENIC is a lightning-fast python implementation of the SCENIC pipeline (Single-Cell ...
SCENIC是一种基于单细胞RNA-seq数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具 这里介绍的步骤方法是针对在R环境中(GENIE3),主要是GENIE3/GRNBoost...
@我是刘小逗 一般用的是Seurat对象
Monocle拟时间分析Monocle可以进行下面三种类型的分析,可以与seurat无缝连接: 1 对细胞进行聚类、分组和计算;2.进行拟时间分析;3.差异表达分析; 2.Constructing ...
Monocle可以进行下面三种类型的分析,可以与seurat无缝连接: 1 对细胞进行聚类、分组和计算;2.进行拟时间分析;3.差异表达分析; 2.Constructing ...
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