TMHMM是用于识别蛋白跨膜结构区域的软件，有在线工具TMHMM 2.0 - DTU Health Tech - Bioinformatic Services[https:/...
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tmhmm 2.0的安装与使用 -
我在帖子里贴了下载链接呀
SCENIC feather文件下载记录
最近在学习SCENIC来分析单细胞转录因子活性。在下载这步就卡住了。教程里需要下载好所需的feather文件 根据教程在RStudio中运行，然后再运行如下代码进行下载：ge...
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您好，我现在跟着您的代码跑还是跑不通，请问怎么找稳定的host呀
biomaRt基因同源转换时 使用中遇到Timeout was reached的解决办法
根据之前别人po文中的代码进行，发现行不通 出现了下面这样子的报错： 看了下bioconduct上管理员还是谁回复的说是近期biomaRt上有很多下载大量数据的人，导致速度变...
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我也不知道咋回事，可能跟网络质量有关吧
SCENIC feather文件下载记录
最近在学习SCENIC来分析单细胞转录因子活性。在下载这步就卡住了。教程里需要下载好所需的feather文件 根据教程在RStudio中运行，然后再运行如下代码进行下载：ge...
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单细胞转录调控网络分析工具（TF，motifs）-SCENIC相信很多专题应该已经讲过SCENIC的使用，这儿，针对我自己对SCENIC的学习使用，遇到的问题做一个详细的讲解说明，希望能对大家理解学习应用SCENIC起到一些帮助。 SC...
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细胞通讯Domino记录Domino算法是由Jennifer H. Elisseeff[https://www.nature.com/articles/s41551-021-00770-5#auth...
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SCENIC feather文件下载记录
最近在学习SCENIC来分析单细胞转录因子活性。在下载这步就卡住了。教程里需要下载好所需的feather文件 根据教程在RStudio中运行，然后再运行如下代码进行下载：ge...
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DiffBand结果差异peaks的width为什么是401？
为什么DiffBand分析所得的差异peaks长度都是401？这个问题一直没找到答案，跟别人的帖子跑的，发现教程的例子peaks的长度不是固定的，找了一些发表的文章中的附表，...
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您好，想请教一下idr的结果该怎么解读呢？比如我分析我的样本通过IDR≤0.05的比例是44%，那可以说这两个样本间重复性好吗？也就是判断样本重复性的标准是什么。 谢谢！
【ATAC-Seq 实战】四、计算插入片段长度，FRiP，IDR值与deeptools可视化
这里是佳奥！ 2022年的最后一天，让我们继续ATAC-Seq的学习！ 1 计算插入片段长度 非冗余非线粒体能够比对的fragment、比对率、NRF、PBC1、PBC2、p...
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【ATAC-Seq 实战】四、计算插入片段长度，FRiP，IDR值与deeptools可视化这里是佳奥！ 2022年的最后一天，让我们继续ATAC-Seq的学习！ 1 计算插入片段长度 非冗余非线粒体能够比对的fragment、比对率、NRF、PBC1、PBC2、p...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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protocol-使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑（一）Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system 最近要开始学习CRISPR-Cas9实验，对着动辄几十页的说明，实在是看不下去...
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我也遇到了，一直显示个在加载的进度条
GREAT网页版学习笔记（预测顺式调控元件）
参考文章：1.使用GREAT对peak进行功能注释2.用网页版工具GREAT来对CHIP-seq的peaks进行下游功能分析 前几天老板心血来潮，在视频里教给我一个软件的使用...
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你好，请问注释完生成的结果中V4，V5到V10这几列数值分别代表什么呢？
使用ChIPseeker对找到的peaks文件进行注释
from Jimmy 读入peaks there are 26029 peaks for this data peaks性质 ChIP Peaks over Chromoso...
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ATACseq 分析流程ATACseq 基本原理如下图所示。真核生物 DNA 与核小体结合形成染色质，结合的紧密程度是动态变化的。当 DNA 需要复制或转录时，结合变得松散让 DNA 暴露。暴露的 ...
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Trimmomatic 安装及初步使用
mkdir Trimmomatic#新建文件夹 cd Trimmomatic#进入文件夹 wget http://www.usadellab.org/cms/uploads/...
