240 发简信
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  • SGE投递任务

    创建.sh 文件 #!/bin/bash:环境变量#$-cwd:在当前路径下投递,SGE日志会输出到当前目录#$-S /bin/bash#-j y :-j 将标准输出与标准错...

  • perl模块安装

    cpanm在系统联网的情况下,可以自动安装所需依赖包 下载:wget http://xrl.us/cpanm --no-check-certificate -O /sbin/...

  • 展示基因家族的结构域

    motif与domain motif(模体)是蛋白中较小的保守序列片段,概念比domain小。PROSITE是专门搜索蛋白motif的数据库,其中signature seqs...

  • linux文本截取

    cut cut以行为处理单位,提取指定区域数据。 cut -bn <file>,以字节(byte)为分割单位-b list 打印出list中指定位置字节,制表符和空格符均为...

  • 基因家族分析策略

    基本分析内容 数据库检索与成员鉴定 进化树构建 保守domain和motif分析 基因结构分析 转录组或荧光定量表达分析 数据库检索与成员鉴定 1. 数据库检索 一般在以下数...

  • Windows下安装使用circos

    简介 Circos是通过圆环布局进行数据可视化的软件包,经常用于基因组数据的可视化展现。 下载安装 下载地址:http://circos.ca/software/downlo...

  • HTML常用标签

    基础标签 <!DOCTYPE>:定义文档类型。HTML5中常使用<!DOCTYPE html> : 定义一个HTML文档,告知浏览器这是一个HTML文档,是除了([<!DOC...

  • 转录组分析工具比较(文献讲读)

    原文 翻译版 导读版来自:生信宝典

  • 配置CPAN

    LOCAL_APP=$HOME/perl5/# local perl editionLOCAL_PERL_EDITION=$LOCAL_APP/perlexport PERL...

  • R绘图

    heatmap pheatmap 实例 其他1 其他2 其他3 线图1 线图2 箱线图1 箱线图2 火山图 韦恩图 实例 柱状图 散点图 富集分析泡泡图来自:生信宝典公众号

  • Cytoscape

    简介 Cytoscape是一个开源网络可视化和分析的软件,提供了网络显示、布局、查询等方面的基本功能。主要用于大规模蛋白质与蛋白质互作,蛋白质-DNA和遗传交互的分析。 安装...

  • EVEX查询数据库

    简介 EVEX在线查询数据库:http://evexdb.org/,一款以基因为检索对象,以PubMed和PubMed Central中发表文章的摘要和全文为依据的文本挖掘数...

  • Ensembl数据库

    简介 Ensembl :http://www.ensembl.org/info/data/ftp/index.html,常用的参考基因组和GTF文件下载网站。 Ensembl...

  • Excel插件

    1、全能插件:方方格子 内置了文本处理、批量录入、删除工具、合并转换、重复值工具、数据对比、高级排序等上百个功能。使用说明:http://www.ffcell.com/hom...

  • markdown练习

    简介 markdown是一种轻量级标记语言,支持嵌入html标签。markdown语法说明:http://wowubuntu.com/markdown/ 标题 1、用#标记,...

  • 自述

    一个不怎么勤奋的搬运工 本科四年研究生两年,算得上“入行”许久,然而神马都一知半解,眼瞅着要毕业到社会上讨生活了,决定再发奋努力一把。 本号用来转载各路文章,记录学习进度和状...