IP属地：广西
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Monocle2: reduceDimension()
降维函数在降维的过程中可以 人为去除不感兴趣的变异 的影响 https://rdrr.io/bioc/monocle/man/reducedDimS.html#:~:text...
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AttributeError: np.infty was removed in the NumPy 2.0 release.
常规运行 报错： 报错全文： 尝试回退numpy版本，未果。 决定找到np.infty的确切位置并修改它。 在此文件中找到对 np.infty 的引用，并将其替换为 np.i...
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如何理解all_data_by_genes？
all_data_by_genes是GISTIC2的一个输出文件，绘制变异热图需要从中提取数据。那么，里面的data代表什么呢？官方文档并没有做过多的解释，请求GPT回答如下...
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2025年，TCGA下载这么慢了吗？
TCGA数据下载有几种方法：网页下载；TCGABiolinks下载；gdc-client下载。其中，gdc-client[https://gdc.cancer.gov/acc...
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如何理解重心坐标系命运矩阵？
在wot包的notebook 5中，展示了命运矩阵的一种重心坐标系可视化。原文如下：The resulting dataset fate_ds contains the fa...
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2025-04-22 NMF如何设置多核运行？
📚 NMF 并行计算说明（中文翻译） Source: NMF-vignette.pdf[https://cran.r-project.org/web/packages/NMF...
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Which nmf method should I use dealing with sc-RNA data?
NMF，非负矩阵分解，被用来进行单细胞特征分析、聚类。但是NMF有几个method，见下列函数的输出。 这些都是什么意思呢？NMF-vignette.pdf[https://...
