基本概念 Nextflow是一个反应式工作流框架和编程DSL，可以简化数据密集型pipelines的编写。 它的设计理念是Linux平台是数据科学的通用语言。Linux提供了...
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NextFlow用法1--基本概念 -
conda create 过程中可能遇到的问题
在conda创建环境过程中，最常见的问题有几种1、镜像源的问题中科大的镜像好像有问题，需要把镜像源修改为清华源2、网络的问题An HTTP error occurred wh...
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bcl2fastq 产生的多个lane 的fastq.gz 合并
bcl2fastq 产生的文件结果如下（4个lane fastq.gz 文件）： 现在要将多个lane 的fastq.gz合并，方便下步骤的分析。 方法1： 方法1： 结果分...
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跟着Nature Genetics学画图：R语言ggbio包画基因结构图论文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...
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用R进行microarray分析（1）Introduction 目前主流的表达谱芯片有两类：（1）cDNA microarray：将100~5,000bp的cDNA固载到介质上 (例如玻璃)，Stanford开发...
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R语言GOplot画弦图展示GO富集分析的结果之如何准备自己的数据我们首先运行帮助文档里的例子看例子里画图用到的数据是什么样子的 查看帮助文档 运行示例数据获得画弦图的数据 把这个示例数据写出到csv文件里 作图的数据是这样的，我们模仿这个...
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R语言ggplot2作图一些好看的颜色搭配这些颜色来自于网页链接 https://www.royfrancis.com/elegant-scientific-graphs-learning-from-examples...
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「摸鱼快报004」让R自己告诉你：我运行完啦你是否经常查看大型的R脚本是否运行完而盯着屏幕看了一夜？你是否经常程序跑挂了也不知道傻傻的等了一夜第二天一查看才发现运行到五分钟的时候就报错停止了？反正我经常有！所以今天安利...
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conda的安装与使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信软件都可以通过conda安装，省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件，conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问我gatk 3.8的版本在哪里...
