已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在线工具Idiographica,虽然能绘制直的...

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已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在线工具Idiographica,虽然能绘制直的...
作者:白介素2 美图神器ggstatsplot-专为学术论文而生 在CRAN(comprehensive R Achive Netwokrk)中已有13000多个R包了简单讲...
WGCNA分析基于两个假设:1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路,2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点,可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...
R在读取和处理数据的过程中会将所有的变量和占用都储存在RAM当中,这样一来,对于海量的单细胞RNA-seq数据(尤其是超过250k的细胞量),即使在服务器当中运行,Seura...
先上图 在做完WGCNA之后,我锁定了两个模块,但是怎么展示这两组的KEGG结果又不会凌乱呢?我最后想到了如上图。 做KEGG富集分析 其中colnames(turquois...
pagoda是2016年在nature methods发表的一个分析单细胞测序的方法,这个包并不是很红火,只是最近在学习另一个基于RNA速率推断细胞演化的R包velocyto...
Purpose: To validate the cell type enrichment results from the xCell, do correlation an...
基因组组装 基因组是怎么组装的,目前的方法有什么局限性?为什么要进行基因组组装?是因为目前的测序方法,无论是一代、二代、三代都是借助于全基因组鸟枪法(Whole genome...