8月初朋友推荐我看这本《中国人英语自学方法教程》，结果看完后，我肠子都悔青了。 这本书的封面我有印象，6年前我看到过，但却没买，因为那时看过一个博主的分享，这本书主要讲的是用...
发简信
IP属地：山西
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如果6年前读到这本书，我至少可以省2年
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你真厉害，我觉得你写出理论来了，特别好
英语听力和口语的理论基础
为什么我们听力不好。 很多人把自己听力不好怪在不会连读上，所以认为要学习和练习连读，这个想法是不正确的。比如come in，连读后听起来是“comin”，但之所以能听懂，并不...
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好文章，讲的透彻
5分钟让你明白“软链接”和“硬链接”的区别
今天在知乎上看到一篇十分有趣的问题：如何评价微软高级工程师痴迷于soft link这一linux常见概念？ 虽然又是知名撕逼王曾某的撕逼帖，但是我还是想就题目中链接的问题简单...
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用PLAM下的mcmctree做分歧时间估计
用mcmctree做分歧时间估计的时候遇到报错： 问题是序列不符合phylip格式，每个名字没有区分开 1.使用以下命令行将orthofinder处理好的多序列比对结果，fa...
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-x 提取CDS -y 提取pep
#GTF/GFF格式# gffread入门使用
首先了解一下GTF/GFF的格式https://asia.ensembl.org/info/website/upload/gff.html两者的关系如下 GTF (gene ...
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楼主写的这里：
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#根据hg19.fa提取CDS序列
gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -y tr_cds.fa
#翻译后蛋白序列
gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -x cds.fa
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是不是写反了？我想提CDS文件，用第一个命令，出来的tr_cds.fa是蛋白文件，
用gffread -h（help命令）看了下，是这样写的：
-x write a fasta file with spliced CDS for each GFF transcript（提CDS？）
-y write a protein fasta file with the translation of CDS for each record（提的CDS文件转成pep？）
所以是不是 “-x” 和“-y” 写反了？ -
#GTF/GFF格式# gffread入门使用
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楼主真棒
R ggplot2 中reorder()如何降序
喜大普奔，终于解决了reorder()降序排序的问题；举例说明一下：首先我有两列数据：第一列是样品名，第二列是对应数值。 先画个简单的barplot： 如下图： 我想将x轴排...
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写系列文章，山庄记，爱的主题，中医，军事，数理化，天文依然显现刍形，世界各民族神话传说，中国文学家研究系列。<br><br>打造高端知识结构，更多的是不断地学习，以系列文为基础，深入突破为主旨！
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生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程
最近Orthofinder2开始陆续更新，文章已经投发到biorkix上，在网上搜了一圈，关于Orthofinder的使用的中文教程几乎是空白的，这周就借此机会和大家一起来学...
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文笔真流畅，通俗易懂，什么专业的呀？
地球史植物进化《三》
这是一棵树，可这颗树不简单哪！生長了多少亿年了。 树中有多少种树？多少目？每个目中有多少品种？ 让我们将会慢慢解读，这颗树的树龄有几十亿年了。 树名叫做:植树进化树。 它是和...
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写的真好
富集分析集锦
搜罗了几篇富集分析的文章，把自己觉得特别好的在此集中展出，感谢各位作者！ 转自刘小泽，Enrich me! 不管是转录组，还是芯片数据，或者其他有关基因的组学分析，每当数据分...
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作者写的特别详细加油!
使用cd-hit对蛋白质或核酸序列进行聚类
2018.9.7 星期四 多云 biolearn cd-hit 是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具，根据序列的相似度对序列进行聚类以去除冗余的序列，一般用于构建非冗余...
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请问你修改了代码了吗
构建自己物种的orgDb
1.首先安装eggnog-mapper软件 注释所需要的物种数据库网址如下，同时也可以用里面的脚本download_eggnog_data.py下载你所需要的数据库： egg...
