1 摘要 简单且高效地分析RNA测序数据的能力正是Bioconductor的核心优势之一。在获得RNA-seq基因表达矩阵后，通常需要对数据进行预处理、探索性数据分析、差异表...
发简信
IP属地：浙江
-
使用limma、Glimma和edgeR对RNA-seq数据分析笔记 -
「答果子问」R语言如何提取特定的字符串R语言如何提取特定的字符串 这个帖子是为了果子的一个提问 R语言能不能实现匹配括号里面的内容, 但是不包括括号 这个问题来自于他的一篇帖子有些GEO平台的探针转换比较麻烦, ...
-
Linux学习-java: 8: Syntax error: Unterminated quoted string
运行环境： conda 4.10.3 conda create -n chipseq python=3.6 conda install -c bioconda paral...
-
多种批次效应去除的方法比较-转自生信技能树
多种批次效应去除的方法比较 原创 生信技能树 前面我在生信技能树推文：你确定你的差异基因找对了吗？ 提出了文章的转录组数据的60个样品并没有按照毒品上瘾与否这个表型来区分，而...
-
转录组分析1 各种生信数据格式fq、fa、sam、bam等sra和fq 1 sra或fq（fastq），都是测序格式的文件。通俗理解：sra是把双端测序的2个文件合成了1个，而fq文件是2个。因为后续很多分析仪fastq格式文件进行...
-
基因相关性+药物敏感性分析①高低风险组某基因表达量差异分析 ②药物敏感性分析 安装 pRRophetic 包，首先要安装它的依赖包 依赖包安装成功后，从本地安装pRRophetic压缩包 安装好之后我...
-
DoHeatmap的优化+ComplexHeatmap绘制带特定基因的单细胞热图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...
