在这篇文章中，作者提到候选基因受到正选择。看附表19给的数据，该说法的依据是作者对普通荞麦和苦荞的直系同源基因对做了Ka/Ks分析，其值大于1。 今天的推送，将介绍如何对两个...
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生信分析23：基因对之间的正选择分析 -
KaKs_Calculator 3.0（2.0）的安装与使用（搭配ParaAT）1 介绍 参考文献：Zhang Z . KaKs_calculator 3.0: Calculating selective pressure on coding and n...
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记一次数据分析--基因的聚类分析溯源--进化树构建接着上一个视屏讲，很多人说代码的输出结果看不懂，今天详细聊一下 今天选择了11个沙门菌进行聚类分析，最终构建进化树 聚类(Cluster)分析顾名思义就是指将研究的对象进行分...
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使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析（有参情况）寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关，例如，比较患病个体与正常个体的组织表达谱，不难想到这些显著...
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【基因组注释】ncRNA注释1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA，它...
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【基因组学】从基因组中提取基因序列，一段序列及相应的注释文件
写在前面要让从基因组中获取信息变得像喝水那样简单。 --by zhougengxu 预先准备 我以水稻基因组为例，像大家介绍如何提取序列。 基因组文件：水稻基因组，水稻...
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[基因组工具]seqkit的使用
SeqKit的学习 --20191017 软件的介绍 SeqKit是一种跨平台的、极快的，全面的fasta/q处理工具。SeqKit为所有的主流操作系统提供了一种可执行的双元...
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用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
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跟着Nature Communications学作图：synvisio在线工具展示MCScanX共线性分析的结果synvisio在线工具 链接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.github.io/]之前知道这个工具，但是没有搞懂...
