共病遗传（或称异病同根），我们对疾病的认识从回溯至遗传学根源的那一刻起就已经进入了另一个新的里程。 今天我想分享一篇今年9月24日发表于 《Nature communicat...
发简信
IP属地：上海
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共病遗传的研究方法：关于多发性硬化症和炎症性肠炎遗传共病研究的例子 -
@freemandjango 没反啊
为什么说FPKM和RPKM都错了？
这本是三年多之前我发在公众号上的一篇旧文，一些偶然的机会，发现不少朋友也在讨论这个问题，因此我重新做了梳理并发出来。这样的讨论是有益的，放在今天也不过时，我也愿意和更多的朋友...
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ilus: 这是我写的一个轻量级全基因组（WGS）和全外显子（WES）最佳实践分析流程生成器不知觉间，距离我写下第一篇关于 WGS 数据分析系列的文章已经过去了三年多（WGS 系列文章[https://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__b...
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基于 Cell ID 的单细胞基因指纹特征提取和细胞身份识别的新方法我想分享一篇今年四月份发表在 《Nature biotechnology》 上的文章，题目是 “Gene signature extraction and cell iden...
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碱基周报（第 005 期）：人类寿命的极限记录每周值得分享的生命科学和生物信息学进展内容，周日发布。 本周话题：人类寿命的极限 上世纪60年代，美国加利福尼亚大学的老年学专家莱纳德·海弗里克用人类表皮细胞作为实验对象...
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碱基周报（第 003 期）：人类起源的故事记录每周值得分享的生命科学和生物信息学进展内容，周日发布。 封面图 本周话题：人类起源的故事 从东非大裂谷形成直到演变成东非稀树草原，地球就进入了人类纪元。从600万年前开始...
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碱基周报（第 002 期）：申请国家自然科学基金记录每周值得分享的生命科学和生物信息学进展内容，周日发布。 本周话题：申请国家自然科学基金 这周在国内很多科研人员来说，最重要的一个事情就是国家自然科学基金（简称：国自然）的...
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我在简书上的大量文章都被锁定了近段时间我在简书上的文章很多都被平台锁定了，应该是我在文章后面留了公众号二维码的原因。目前没有申述成功，那么大家如果要看我之前的文章的话，还需移步到我的同名知乎专栏和同名公众...
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Hands-On Machine Learning with Scikit-Learn and TensorFlow ： Concepts, Tools, and Techniques to Build Intelligent Systems
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基因组学中的深度学习全文6,743字，阅读30分钟。 这一篇文章的主题是深度学习在基因组学中的应用情况的。文章较长，读完要花些时间，不过我的建议是通读第一部分——关于如何进行模型训练的内容，读完...
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为什么不能通过 GATK 的 PL 直接计算基因型剂量（Genotype dosage）
GATK 的 PL 比较特殊，它是不能直接用于基因型剂量（Genotype dosage）的计算的。这次我们就来谈一谈这个问题。 有时候我们需要在项目中用基因型剂量来代替基因...
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@第八天的秘密 😂好多事情啊，我会努力的💪
如何使用Shapeit2对人类基因组数据进行Phasing
在上一篇文章中，分享了有关基因组Phasing的原理，一共有三种，分别是：家系关系分型(Related individuals Phasing)、群体LD分型(LD Phas...
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老板亲自传授的文献阅读方法前言 论一个气场合适的导师的重要性。想起一个微信朋友前截图 A：导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，跟你牛不牛没有关系 B：你错啦，导师牛不牛，师兄师姐牛不牛，很大程度上决定我牛不牛...
